单杂酵母菌p和结果分析
酵母是一种重要的基因工程宿主菌,但是由于其细胞壁结构复杂牢固,质粒拷贝数低的特点,导致普通菌落PCR鉴定酵母细胞内外源基因的成功率较低。
常见酵母菌P解决方案
1)煮沸冷冻法:优点便宜,缺点成功率低、不稳定;
2)酶解法:优点稳定性好,缺点时间长;
3)碱裂解法:优点便宜,缺点产物对PCR有一定的抑制作用,常出现弥散条带;
4)直扩法:优点方便,缺点依赖于高保真酶,对于模板量要求极高,重复性差;
5)提质粒:优点成功率高,缺点步骤复杂。
推荐使用coolaber的SK2420和SK2422试剂盒,采用了酶解+化学裂解的方法,能有效提高破壁效率。另外,高保真PCR Mix,比普通Mix兼容好,扩增效率高。SK2420酵母阳性克隆快速检测试剂盒,用于酵母杂交筛库的阳性克隆鉴定(AD载体)。SK2422酵母基因组菌落PCR试剂盒,用于Y1HGold-pAbAi系统单杂阳性诱饵菌株鉴定(pAbAi载体)。
酵母杂交筛库的阳性克隆鉴定(AD载体)结果分析
1.筛库得到的条带大小是不固定的,主要与诱饵蛋白、文库物种和建库方案有关,一般情况下,文库片段长度范围:650-3000bp,平均长度>1200bp。
2.有多条电泳条带的单克隆(含有多个质粒的转化子),需要在SD/-Leu/AbA筛选培养基上重复划线培养2-3代,然后通过菌落PCR的方法选出具有单个质粒的克隆。
3.对于较短的条带,可能是引物二聚体或空载载体导致的,可以舍弃。
4.长度完全一致的条带可能是重复的基因,根据测序结果再次判断。
单杂阳性诱饵菌株鉴定(pAbAi载体)结果分析