NGS丨解放双手,首选卡盒式建库仪!

文摘   2024-09-10 08:01   上海  

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回顾数月前,我曾撰写了一篇文章(点击阅读:NGS自动建库仪,哪家强?,在其中梳理了市场上主流的建库仪产品,并曾倾向于认为那些专注于自动化设备研发与生产的厂商在这方面表现更佳。然而,经过一段时间的深入思考和行业观察,我逐渐意识到这一观点存在显著的偏差。

从前我是如此进行分类与排序


现在我是如此进行分类与排序


近年,二代测序(NGS)技术广泛应用于临床。而正如此前写过的另一篇文章:医院开展基因检测业务,竟然如此不容易?文中提到的,由于NGS检测流程复杂,涉及核酸提取、文库制备、上机测序、数据分析多个实验环节,且多步实验操作严重依赖于人员操作水平,但如今能够完成这些操作的训练有素的人员实际上很短缺,这也导致医院开展院内基因检测业务时,除了高额的硬件设施投入外,还需要很多额外时间和费用用于人员培训,继而也导致这项业务的开展受到较高的“门槛”限制。

这也是为什么,在2023年12月《中国生物医学工程学报》42卷第6期发布的《临床下一代测序的自动化与常规化专家共识》中提到,制约NGS成熟应用和普及的关键因素之一是自动化程度低

NGS建库流程的高复杂度也是制约各大NGS服务商拓展市场份额的重要桎梏。为了打破这一桎梏,自动化设备的介入将起到决定性的作用。

复杂的反义词是简单,这也意味着对于用户而言,这类仪器使用起来越简单越好。也唯有简便易用的仪器,才能快速广泛普及。

回顾我们此前梳理过的获得NMPA批准的自动建库仪(点击阅读:NGS丨最新已获批NGS自动建库仪清单),观察可见,以移液工作站为基础的自动建库仪占据了绝大多数。


基于移液工作站的自动建库仪最为显著的优点在于其开放性,这一点往往被那些专注于自动化设备研发与生产的厂商作为重点宣传的亮点。

然而,开放性真的就那么理想吗?

近期,我也撰写了几篇文章(点击阅读:实验室自动化丨自动化PK人工,你选谁?实验室自动化自动化设备不应卖得太便宜!以及实验室自动化丨自动化仪器的作用到底是什么?),其中不乏描写自动建库仪开放性的弊端。

开放性虽好,却意味着大量的调试工作。自动化的核心价值在于它能够显著降低培训成本和时间。若追求开放性,则需要使用端反复不断对仪器进行训练和调试。原本是培训人员操作实验,现在却转变为训练仪器来完成实验,这不禁让人质疑:自动化的真正意义又何在呢?

相比之下,卡盒式自动建库仪仅需将样本加入卡盒,之后的流程即可由仪器全自动接管。这不仅操作简便、使用便捷,还能实现真正的无人值守。

因此,从这个维度来看,封闭其实并非劣势,反而论及操作的简便性,卡盒式自动建库仪才是首选。

思路迪ANDiS 500


ANDiS 500全自动封闭基因测序文库制备仪具有一键式、零污染、减人力、省空间等特点,能够完成NGS最复杂的建库环节,为医院内自行开展NGS检测提供最适宜的自动化解决方案。



ANDIS配套封闭式建库卡盒


优点:

  • 简化操作流程:采用预装试剂设计,省去了配置试剂和摆放耗材等繁琐步骤,仅需在建库卡盒的加样孔中添加样本,再将卡盒插入仪器,手工操作<3分钟。之后仪器自动化完成目标区域扩增,连接测序接头、磁珠纯化等文库制备流程。

  • 优化成本效益:设备具备无人值守功能,大幅降低人力开支。此外,系统运行仅消耗卡盒作为唯一耗材,无需额外的枪头、深孔板、PCR板等材料,进一步削减了耗材成本。

  • 节约空间:体积仅相当于微波炉大小,显著减少占地面积,且可叠加扩容,实现空间利用最大化。

  • 零污染:采用封闭式系统设计,彻底防止样品间的交叉污染。

  • 灵活通量:采用独立通道设计,共设有4个独立通道,能够同时处理4个样本,各通道互不干扰,独立作业。1个样本起做,即来即做,且无试剂浪费。

  • 售后无忧:各通道独立,即使一个通道出现故障,其余三个通道依然能够运作,确保实验流程不受影响。故障通道可轻松拆卸,便于及时送修,最大化减少对实验进度的影响。


缺点:

  • 通量较小,提高通量也并非难事,仅需增加设备数量即可。尽管如此,随之而来的成本增加不容忽视。虽然高价位并不构成设备本身的缺陷,但它确实会在一定程度上制约该设备的广泛普及和应用。


杰毅生物NGSmaster


NGSmaster


由4个相同的独立通道组成,每个独立通道包括:用于放置样本和前处理试剂的试剂盘;用于放置试剂盘的底座,底座上设有温控模块和旋转模块;用于实现磁性颗粒分离、清洗和洗脱的磁力分选模块;用于转移试剂盘内试剂的移液装置,移液装置设有移液模块和移液枪头;用于控制温控模块、旋转模块、磁力分选模块和移液模块运行的主机。





该设备的性能特点与思路迪ANDiS 500颇为相似,但它们在实验流程的设计理念上存在显著差异。ANDiS 500采用的是基于扩增子的建库策略,而NGSmaster则采用了PCR-free的建库方法。此外,NGSmaster的独特之处在于它将核酸提取与文库制备步骤合二为一,实现了从样本到文库的全程自动化,极大地简化了操作流程。


身为一名负责基于工作站式自动建库仪产品的销售人员,我本应避免对卡盒式自动建库仪给予过多的赞扬。但经过深入剖析,我不得不承认,这类设备确实具备多项显著优势,尤其是在操作灵活性和使用便捷性方面表现突出。


在临床应用中,样本数量往往不固定,且可能随时送达,传统的移液工作站式建库仪难以实现即时检测。相较之下,卡盒式自动建库仪的各个通道相互独立,能够真正做到即到即检,满足临床样本处理的灵活性需求。


近期,纳米孔测序技术的不断推陈出新,充分展现了测序领域向小型化、快速化发展的趋势。相应地,建库仪的设计理念也应顺应这一潮流,而这类设备无疑与这一发展趋势高度契合。


也是因为思路迪ANDiS 500和杰毅生物NGSmaster这两款设备,我颠覆了原来倾向于认为那些专注于自动化设备研发与生产的厂商在这方面表现更佳的看法,我深刻地认识到,服务端才最懂临床需求(我最近才真正领悟到这类设备的诸多优势,而他人早已将之研发成型,并推向市场)。



进一步地,我意识到,在洞察临床需求方面,服务端的工作人员占据了得天独厚的优势。他们身处一线,通过直接与临床人员的交流,能够迅速而准确地把握住临床中的痛点。这些痛点,往往成为推动产品改进和技术革新的关键。


感慨之余,我也意识到,作为产品推广的一份子,我应当更加积极地与服务端的工作人员以及临床老师们沟通合作,倾听他们的声音,将他们的经验和智慧融入到产品的设计和优化中。只有这样,我们才能研发出更多真正符合临床需求、能够解决实际问题的产品,为改善医疗条件做出应有的贡献。

另外,我也深刻体会到了知识体系的更新速度之快,以及作为一个行业观察者,保持开放心态和持续学习的重要性。未来,我将继续关注NGS自动建库仪的发展,希望能为读者提供更加准确、全面的信息和见解。同时,我也期待与业内同行和广大用户共同探讨,共同推动这一领域的进步。


寻找好用的自动建库仪,探讨自动建库仪使用心得,都欢迎联系




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