论著·Original Article
引用本文：叶定兴, 闫恒, 刘军权, 等. 杂交捕获法二代测序技术在眼部感染病原体检测中的应用初探[J]. 中华眼视光学与视觉科学杂志（中英文）, 2025, 27(1): 36-45.
摘要
目的
初步探讨基于杂交捕获法的二代测序技术在眼部感染病原体检测中的应用价值。
方法
回顾性系列病例研究。随机纳入2021年7月至2023年11月温州医科大学附属眼视光医院确诊为眼部感染且传统病原学检测结果为阳性的入院患者17例（17眼）。所有患者当时收治时根据感染部位采集结膜囊分泌物和角膜刮取物或玻璃体液样本，进行涂片镜检与培养鉴定，剩余样本进行了宏基因组测序（mNGS）和杂交捕获法二代测序（HC-NGS），对3种方法检测到的病原体种类和数量进行分析，并对病原体检出率、混合感染率、病原体种类一致性等进行分析。比较了mNGS和HC-NGS在归一化序列数与耐药基因上的差异。采用费希尔精确检验比较3种方法的检出率和混合感染率差异，采用秩和检验比较分析mNGS和HC-NGS归一化序列数差异。
结果
涂片镜检与培养鉴定、mNGS和HC-NGS分别鉴定出病原体18、31、39株；细菌检出率分别为35%、41%、47%；真菌检出率分别为59%、41%、41%；病毒检出率分别为6%、53%和65%。与涂片镜检和培养鉴定相比，HC-NGS和mNGS明显提高了病毒检出率（χ2 =7.70，P=0.008；χ2 =12.88，P=0.001）。涂片镜检与培养鉴定、mNGS、HC-NGS检出的混合感染率分别为6%、47%和53%，后2 种方法的检出率明显高于前者（χ2=7.40，P=0.017；χ2=9.07，P=0.007）。涂片镜检与培养鉴定、mNGS、HC-NGS检测到的病原体种类分别为14、23和29种。病原体种类一致性方面，18%的样本在3种方法中完全一致；35%的样本在3种方法中部分一致，且HC-NGS和mNGS检测出的病原体包含了通过涂片镜检与培养鉴定检测到的所有病原体；35%的样本在HC-NGS和mNGS之间完全一致；12%的样本在HC-NGS和mNGS之间具有部分一致，且前者包含后者检测到的所有病原体。此外，HC-NGS比mNGS具有更多的归一化序列数（W=496.00，P<0.001），并且检测到更多的耐药基因。
结论
HC-NGS在眼部感染病原体检测中病原体检出率高、病原体覆盖范围广，并能检测到更多的耐药基因，具有较好的应用潜力。
关键词
病原体；眼部感染；杂交捕获法；二代测序
基金项目
温州市科技局重大科研创新攻关项目（ZX-ZY2022018）；温州市科技局基础性科研项目（Y2023789）
作者单位：
1 温州医科大学附属眼视光医院 国家眼耳鼻喉疾病（眼部疾病）临床医学研究中心，温州 325027；
2 杭州金域医学检验实验室有限公司，杭州310000
第一作者：叶定兴，Email：383097119@qq.com
通信作者：郑美琴，Email：zmq@eye.ac.cn
引用本文：
叶定兴, 闫恒, 刘军权, 等. 杂交捕获法二代测序技术在眼部感染病原体检测中的应用初探[J]. 中华眼视光学与视觉科学杂志（中英文）, 2025, 27(1): 36-45.
DOI: 10.3760/cma.j.cn115909-20240913-00302.
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