Ecology | 土壤种子库丰富度、密度和丰度的全球数据库

文摘   2024-10-06 22:45   江苏  

土壤种子库是自然储存在土壤中的有活力种子的总称。在物种或种群层面,形成种子库的能力代表了一种在受到干扰或局域环境条件发生其他变化后(重新)定殖的策略。在群落层面,种子库被认为可以在环境变化期间缓冲局域的多样性,并经常与被动生境恢复的潜力相关联进行研究。种子库在植物种群和群落动态中所扮演的角色,以及在农业领域的重要性,意味着它们在生态研究中被广泛研究。该数据库是全面文献检索的结果,包括Web of Science中可提取数据的所有种子库研究,以及对俄语文献的额外检索。该数据库包含从1940年至2020年间发表的1,442项研究中提取的3,096条记录的物种丰富度、种子密度和/或种子丰度信息,这些记录至少来自世界七大洲的1,929个地点。记录分为五大生境类别(水生、耕地、森林、草地(包括灌丛)和湿地),包括与生境退化或恢复到其他生境有关的信息(共14种组合)。此外,还提取了每条记录的采样规程,并对数据库进行了广泛的错误检查。然后利用每条记录的位置,从外部公布的数据库中提取气候数据摘要和生物群落分类。该数据库有多种潜在用途。与许多其他全球生物多样性数据集相比,该数据库具有较大的地域分布范围,可用于研究生物地理学或宏观生态学背景下的多样性模式。生境类型和状态(完好、退化和恢复)可用于为生物多样性保护提供见解,而取样方法和努力的潜在影响可用于为未来种子库研究的优化数据收集提供信息。本数据库采用CC-BY许可发布。

  • 数据可用性声明

数据和代码在Data S1中作为支持信息提供。数据也存档在https://doi.org/10.5878/bvs7-gk47Swedish National Data Service中。


  • 文献信息

题目
A global database of soil seed bank richness, density, and abundance
期刊
Ecology (IF = 4.4)
作者
Alistair G. Auffret*, Emma Ladouceur, Natalie S. Haussmann, Eirini Daouti, Tatiana G. Elumeeva, Ineta Kačergytė, Jonas Knape, Dorota Kotowska, Matthew Low, Vladimir G. Onipchenko, Matthieu Paquet, Diana Rubene, Jan Plue
发布日期
2024 年 10 月 2  日
DOI
https://doi.org/10.1002/ecy.4438
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Biodiversity Monitoring
生物多样性;监测保护;群落生态;生态统计;R语言;python。 主要分享一些前沿的文献和方法实例,更新看心情和时间。
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