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微生物组专题(202407更新) | 干货

企业科学 2024-07-09 17:35 浙江

肿瘤微生物Hot

【万字综述】Protein & Cell：微生物，肿瘤微环境中的不速之客 | 微生物专题

【收藏】2008-2020肿瘤组织微生物组研究纵览 | 微生物专题

细菌为什么能定植在肿瘤中？| 微生物专题

做肿瘤微生物检测，这些问题需重视! | 肿瘤微生物

Science：1526份7类肿瘤组织实证肿瘤细胞和免疫细胞中存在细菌 | 微生物专题

Nature：Rob Knight团队发现血液和组织微生物组可诊断癌症|微生物专题

肿瘤微生物：瘤内微生物是如何促进胰腺癌发生？| 微生物专题

于君组Gastroenterology揭示CRC瘤内微生物异质性 | 肿瘤微生物

NC文章教你做高质量的肿瘤微生物组研究 | 肿瘤微生物

10分+文章带你揭开TP53-微生物-肺癌之间的关系 | 肿瘤微生物

做肿瘤微生物检测，这些实验设计你都知道吗？| 肿瘤微生物

Nature：黑色素瘤内细菌来源的多肽或是免疫治疗新靶点 | 肿瘤微生物

做肿瘤微生物检测，这些检出的菌可能来自污染！| 肿瘤微生物

除了测序，还有哪些方法能证实肿瘤组织中存在微生物？| 肿瘤微生物

【收藏】24类肿瘤的微生物组高分文献集锦(上) | 肿瘤微生物

【收藏】24类肿瘤的微生物组高分文献集锦(下) | 肿瘤微生物

组织微生物研究面临的挑战之人类基因非特异性扩增 | 肿瘤微生物

最近发Cell的肿瘤微生物组，你都了解吗？| 微生物专题

万万没想到！FFPE样本居然还能做肿瘤微生物组！|微生物专题

讲座回顾｜FFPE释放新价值：肿瘤组织微生物组研究思路解析

16分肿瘤微生物组研究怎么做？6月8日特邀一作来为你解析 |直播预告

官宣CP！肿瘤微生物组 × 外显子组 | 微生物专题

肿瘤微生物＋多组学轻松登上33分的JAMA Oncology

肿瘤微生物组新知：肿瘤内微生物群在癌症转移中的新作用 | 微生物专题

于君组是如何讨论肿瘤内微生物异质性及与突变的关系 | 肿瘤微生物组

肿瘤内微生物还能增强宿主的抗肿瘤作用？ |微生物专题

肿瘤微生物特征呈现抗肿瘤活性 | 微生物专题

联川用户文章3连发：组织与瘤内微生物组5R 16S测序该怎么玩 | 微生物专题

肿瘤微生物群的空间分布如何影响肿瘤异质性？ | 微生物专题

肿瘤微生物组影响胰腺癌预后 | 微生物专题

肝细胞癌的肿瘤微生物组特征 | 肿瘤微生物

NEW

肿瘤微生物组新知：肿瘤内微生物群在癌症转移中的新作用 | 微生物专题

微生物组学基础知识

涨姿势 |《宏基因组学那些事》之名词解释

涨姿势 |《宏基因组学那些事》之图表说上篇

涨姿势 |《宏基因组学那些事》之图表说下篇

涨姿势 |《宏基因组学那些事》之数据库与软件

实验室小哥哥整理的扩增子测序必备知识

宏基因组背景介绍 | 微生物专题

宏基因组最热应用领域介绍 | 微生物专题

16S测序和宏基因组测序有什么区别？｜宏基因组专题

微生物研究必知的6个知识点 | 16S专题

关于微生物研究的十问十答 | 学习专栏

“含蓄又热烈的爱”一个内生菌的自白|微生物专题

内生菌是如何进入植物体内的？|微生物专题

内生菌研究四大方向都有哪些？|微生物专题

微生物组学进阶

细菌为什么能定植在肿瘤中？| 微生物专题

【收藏】2008-2020肿瘤组织微生物组研究纵览 | 微生物专题

连2021国自然基金委都在推荐的微生物单细胞测序不了解下？| 微生物专题

“含蓄又热烈的爱”一个内生菌的自白|微生物专题

【万字综述】Protein & Cell：微生物，肿瘤微环境中的不速之客 | 微生物专题

Nature综述：肠道菌群与结直肠癌的研究进展 | 微生物专题

Nature综述：肠道微生物在人类代谢健康与疾病中的作用 | 微生物专题

精华版Cell子刊综述：口腔宿主-微生物相互作用组 | 微生物专题

Cell子刊综述：口腔微生物群的部位特征 | 微生物专题

9分综述：口腔菌群怎样与前列腺疾病发生关系 | 微生物专题

Environmental Microbiology/ Venn图：寻找核心微生物组 | 微生物专题

根际微生物对植物开花的影响 | 微生物专题

干旱和寄主选择对根微生物群落动态的影响 | 微生物专题

全球柑橘的根际微生物结构与功能组成 | 微生物专题

Nat Rev Microbiol：植物微生物组互作：从群落装配到植物健康| 微生物专题

【知识库】常见肠道菌群代谢产物和功能汇总 | 微生物专题

中国土壤微生物组：进展与展望* | 微生物专题

Nature Reviews Microbiology：分析微生物组的最佳实践 | 全文解读

证明肠道菌群与疾病的因果关系，你需要遵守“科赫法则”| 微生物专题

肠道菌群与疾病因果性的研究策略 | 微生物专题

一文了解菌群在胃肠道不同部位的分布特征 | 微生物专题

不同肠段的微生物及其功能比较 | 微生物专题

做了16S测序，为什么还要做宏基因组测序？| 微生物专题

高手是怎么用宏基因组测序的？| 微生物专题

基于宏基因组和单细胞RNA测序的奶牛瘤胃纤维利用研究 | 微生物专题

NovaSeq PE250微生物检测平台

扩增子测序，测得更长好还是测得数据更多好？| 微生物专题

研究者推荐高数据量PE250模式开展扩增子测序实验 | 微生物专题

NovaSeq PE250更优的微生物组测序平台 | 微生物专题

PE250扩增子测序助力从5分+到10分+的微生物组学文章 | 微生物专题

深度PE250扩增子测序揭示益生菌是如何塑造仔鱼的肠道菌群 | 微生物专题

从illumina测序仪进化史中，找到更优秀的微生物组测序工具 | 微生物专题

一封来自Illumina的回信 | 微生物专题

怎么准备实验样本

做肿瘤微生物检测，这些问题需重视! | 肿瘤微生物

扩增子测序样本寄送指南 | 实验技术专栏

微生物实验样本获取及制备指南（上篇） | 16S专题

微生物实验样本获取及制备指南（下篇） | 16S专题

你的样品你做主 | 样本篇

PCR原理及扩增影响条件相关知识分享 | 技术专栏

影响PCR扩增成功率的因素 | 技术专题

DNA提取相关知识分享 | 实验技术专题

一篇文章带你了解保存粪便的常用方法 | 微生物专题

三分钟了解都有哪些粪菌保存液？| 微生物专题

知道这些，微生物DNA提取易如反掌 |不收藏就亏了系列

如何采集植物微生态样本，看这篇就够了！

手把手带你做微生物组研究

ProteinCell：扩增子和宏基因组数据分析实用指南 | 微生物专题

微生物文章投哪里（2020版）| 微生物专题

查找病菌中与感染宿主相关的基因 | 微生物专题

一篇医学微生物组16S测序文章必备的五个内容 | 微生物专题

一篇医学微生物组16S测序文章必备的六张图 | 微生物专题

宏基因组研究怎么做，联川教你| 微生物专题

5500字带新手吃透一篇5分肠道菌群文章的内核 | 微生物专题

微生物研究中常见图表含义说明 | 16S专题

微生物研究中常见图表绘制方法大全 | 16S专题

新的植物内生细菌特异性16S引物及测评 | 微生物专题

肠道菌群研究：新手上路 | 微生物专题

课程通知 | 微生物与疾病发生及耐药研究

MEGA软件下载安装&序列处理&进化树绘制&Newick格式介绍

16S在线功能预测分析 | 分析技能

组间差异分析神器-STAMP | 分析技能

宏基因组测序这么用，让你的微生物研究芜湖起飞 | 微生物专题

微生物组因果性研究怎么做？Nature子刊告诉你答案

史上最全的肠道菌群研究数据库，建议收藏！|微生物专题

一步一图详解最新的SRA数据上传方法（内含常见报错解决方法） | 微生物专题

除了SRA，数据上传国内的GSA也是极好的（详尽版操作指南）

【收藏】一文讲透环境微生物组研究怎么做 | 微生物专题

LNA-16S测序鉴定植物内生细菌占比高达99% | 微生物专题

怎样才能把微生物文章发的好，从用户文章中找答案

NC：菌群标志物鉴定×因果关系验证 | 微生物专题

微生物组新知：72分综述解析菌群与人体健康

这些研究思路值得你借鉴

医学方向

于君组Gastroenterology揭示CRC瘤内微生物异质性 | 肿瘤微生物

NC文章教你做高质量的肿瘤微生物组研究 | 肿瘤微生物

10分+文章带你揭开TP53-微生物-肺癌之间的关系 | 肿瘤微生物

肿瘤微生物：瘤内微生物是如何促进胰腺癌发生？| 微生物专题

Science：1526份7类肿瘤组织实证肿瘤细胞和免疫细胞中存在细菌 | 微生物专题

Nature：Rob Knight团队发现血液和组织微生物组可诊断癌症|微生物专题

什么？没有阳性结果也可以发Nature主刊！|人类胎盘无菌|微生物组

肠道菌群和单细胞在一起就能发Nature？| 微生物专题

Cell：肠道菌群促进帕金森发生 | 微生物专题

10分项目文章：不做机制，也能出高分文章 | 微生物专题

Gut Microbes：孤独症的基因变异与肠道菌群、代谢物和细胞因子改变有关

我的领域文章众多，还能发高分文章吗，这篇Nature Microbiology文章会回答你的疑问 | 微生物专题

CHM：宏基因组测序揭示新生儿肠道菌群的动与静 | 微生物专题

Arthritis Rheumatology：张烜+王军发表系统性红斑狼疮患者的肠道菌群变化|微生物专题

结肠炎治疗后抗生素依赖与肠道微生物的关系|微生物专题

Nature Medicine：为什么别人的肠道菌群与结直肠癌关系研究能发Nature Medicine | 微生物专题

Gut文章教你讨论中药、肠道菌群与抗肥胖的因果关系 | 微生物专题

Gut：胃癌切除术后，肠道菌群和代谢组发生了哪些变化？|微生物专题

Nat Med：肠道菌群–胆汁酸–白介素22轴协同调节多囊卵巢综合征 | 微生物专题

Microbiome：不同严重程度的冠心病可用肠道菌群和代谢组来鉴别 | 微生物专题

Hypertension：血管紧张素介导的代谢组变化依赖于肠道菌群 | 微生物专题

24小时血压测量+肠道菌群+代谢组=Hypertension | 微生物专题

Gut：人体口腔菌群的稳定性和动态变化规律 | 微生物专题

8分+项目文章：除了肠道菌群，这里的菌群也大有可为！| 微生物专题

口腔微生物生态位特化与鼻咽癌风险有关 | 微生物专题

口腔微生态：头颈癌患者口腔菌群影响口腔粘膜炎的发病(6分) | 微生物专题

口腔微生态：重新开始口服食物后肠内营养对口腔和肠道菌群的影响 | 微生物专题

反流性食管炎患者与健康人群口腔微生物差异性研究 | 微生物专题

ISME：宏基因组测序揭示T2DM患者中与牙周炎相关的龈下菌群| 微生物专题

NC：微生物组+转录组揭示炎症性皮肤病中的微生物-宿主相互作用 | 微生物专题

中药葛根芩连汤的抗肿瘤机制研究怎样发到Cell Death & Disease

菊粉通过部分恢复肠道菌群介导的瘦素相关通路，缓解ob/ob小鼠代谢紊乱 | 微生物专题

微生物组+转录组联合研究揭示治疗艰难梭菌感染的新机制 | 微生物专题

肠道菌群通过”肠脑轴”介导间歇性禁食减轻糖尿病引起的认知障碍 | 微生物专题

微生物组+转录组联合研究揭示治疗艰难梭菌感染的新机制 | 微生物专题

微生物组学在肿瘤研究中的新思路 | 微生物专题

5500字带新手吃透一篇5分肠道菌群文章的内核 | 微生物专题

只做16S测序就发12分文章，怎么做到的？| 微生物专题

肠道菌群+自闭症+16S测序+180个样本 = 6.6分文章 | 微生物专题

肠道菌群+精神分裂症+宏基因组测序+16S测序+84对样本 = 6分文章 | 微生物专题

如何用肠道微生物组鉴定原因不明疾病的分子标志物 | 微生物专题

用多组学方法研究不同地区人群的肠道菌群组成与功能差异 | 微生物专题

千人队列研究：肠道菌群是如何影响人类肥胖 | 微生物专题

跨学科研究：从肠道菌群评估纳米材料的安全性 | 微生物专题

性别居然会决定抗生素对肠道菌群和代谢的作用效果 | 微生物专题

宏基因组测序再挖结直肠癌新标志物—细菌基因 | 微生物专题

170例宏基因组数据揭示肠道菌群与强直性脊柱炎的关系 | 微生物专题

宏基因组+宏蛋白质组揭示糖尿病发生中的肠道菌群变化 | 微生物专题

中药女贞子通过调节肠道菌群多样性来保护骨质 | 微生物专题

13分项目文章：肠道菌群+代谢组+转录组揭开生酮饮食改善结肠炎的机制 | 微生物专题

文献解读：肠道菌群差异、膳食纤维及两者的相互作用对宿主代谢的影响

10分用户文章教你如何研究新冠患者肠道菌群

12分项目文章：不做机制，也能出高分文章 | 微生物专题

单细胞搭配微生物组怎么玩？快来围观！|单细胞专题

Microbiome：影响早产儿菌群发育成熟的因素 | 微生物专题

10分文章教你如何设计机制研究类文章-冷暴露+肠道菌群+高血压潜在机制研究 |微生物专题

菌群功能因果性验证怎么做？高高手给你支招！

2月，最值得看的30篇肠道健康文献！ | 热心肠日报

农学方向

Microbiome：根系分泌物驱动土壤记忆抵御植物病原菌 | 微生物专题

Nat Biotechnol：地球微生物组的基因组目录 | 微生物专题

New Phytologist：植物招募有益菌抵抗土传病原菌的证据 | 微生物专题

Microbiome：稻田土壤产甲烷菌的共存模式与什么相关？| 微生物专题

Microbiome：土壤微生物群落对有机和无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力 | 微生物专题

mSystems：水稻SST基因调控根际微生物协同耐盐的机制 | 微生物专题

Science：病原菌激活植物内生菌群的抑病功能|微生物专题

Nat Microbiol：根际微生物对铁的竞争驱动病原体的控制 | 微生物专题

Nat Commun：宏基因组学揭示植物与根际微生物在干旱下的互作机制

文献解读 | 绵羊瘤胃微生物群甲烷产量表型与基因表达差异有关

腐根对土壤微生物和植物的生长健康有何影响 | 微生物专题

不同农残堆肥对微生物群落和功能多样性的影响| 微生物专题

土壤微生物网络中核心菌群丰度与农业生态系统的高功能潜力有关 | 微生物专题

长期使用污泥污水对农田微生物的影响 | 微生物专题

毛果杨寄主基因型对根际微生物群落分化研究 | 微生物专题

Cell：土传遗产 | 微生物专题

science评论 | 土壤微生物能够直接增强作物的抗盐碱能力，还能增加产量？！| 微生物专题

Nature子刊 |土壤微生物已成为帮助减轻气候变化负面影响的潜在方法 | 微生物专题

土壤微生态的五大研究方向 |cell 子刊综述解读助力微生物组研究

Microbiome：利用土壤细菌群落预测土壤理化指标与土壤质量 | 微生物专题

微生物组用户ISME文章：宿主性别可以决定肠道微生物对寄生虫感染的响应 | 微生物专题

微囊藻毒素LR对淡水螯虾的组织病理影响 | 微生物专题

温度和土壤水分控制微地形生态系统的微生物群落组成 | 微生物专题

怎样把土壤微生物与植物感病的互作关系做到10分 | 微生物专题

草原造林对土壤微生物组群落结构和功能的影响 | 微生物专题

重金属对异源三倍体芒草奇岗根系微生物的影响 | 微生物专题

用户文章断奶改变猪的肠道微生物区系进而调节肠道中营养代谢相关的基因表达 | 微生物专题

用户文章垂直流人工湿地中抗生素和氮的同时去除：基质的影响和微生物功能的响应

“好”土养”好“牛，“好”牛产“好”奶，土壤和肠道微生物也能联合起来“搞事情”| 微生物专题

Microbiome：根际群落的选择揭示出可降低根病的细菌 | 微生物专题

Microbiome：田间玉米苯并噁嗪塑造微生物群的特异性与保守性模式 | 微生物专题

Nature plants：植物塑造根际微生物组新机制 | 微生物专题

9分研究：冰川源水体和沉积物细菌群落存在显著差异 | 微生物专题

磷化工业区域农田土壤抗生素耐药的发生 | 微生物专题

8分文章深入解析微塑料对小麦幼苗生长的影响机理 | 微生物专题

玉米内生菌：抵御真菌、促进生长| 微生物专题

8分文章揭示两种地貌森林土壤微生物群落组成和相互作用差异 | 微生物专题

内生菌促进冰草生长和耐盐的机制 | 微生物专题

干旱胁迫对甘蔗根际微生物的影响 | 微生物专题

根际和内生微生物群落的相互作用对新疆棉花生长的影响|微生物专题

根际细菌、古菌、真菌是如何影响植物的金属超积累 | 微生物专题

水稻驯化过程对根际微生物组功能潜力的影响 | 微生物专题

10分文章解读生物可降解塑料对土壤微生物的影响 | 微生物专题

菌群在超积累景天科植物中的作用 | 微生物专题

环境与生物地理因素对干旱单种红树林土壤群落研究 | 微生物专题

地膜覆盖对农田菌群多样性及其功能的影响| 微生物专题

怎么讨论根际微生物组可以发10分New Phytologist | 微生物专题

如何设计病原菌与植物内生菌的相互作用的实验 | 微生物专题

怎样简单设计根际微生物对胁迫条件响应的实验 | 微生物专题

怎样开展海域沉积物微生物群落结构及代谢潜力分析 | 微生物专题

臭氧水灌溉会怎样影响作物生长和土壤微生物群落结构 | 微生物专题

厌氧处理对微生物群落及抗生素耐药基因的影响| 微生物专题

揭开镉污染稻田中不同水稻品种的内生细菌群落结构 | 微生物专题

灰叶枯病茶树根际分泌物招募微生物以抵御病原体侵染 | 微生物专题

土壤初始细菌多样性和养分有效性决定了外源生物降解的速率| 微生物专题

10分+讨论银暴露形式对土壤微生物组的作用 | 微生物专题

养殖场沉积物中微生物群落如何响应污染时间地点变化？| 微生物专题

木片生物反应器中哪些菌群在发挥作用？| 微生物专题

Environmental Pollution：微污染物会对地下水微生物群产生怎样的影响|微生物专题

如何探究影响湖泊微生物群落结构季节性变化的因素？| 微生物专题

发Microbiome有方法吗？| 微生物专题

功能基因篇：一文带你了解氮循环功能基因 | 微生物专题

功能基因篇：一文带你了解磷循环功能基因 | 微生物专题

NEW

功能基因篇：微生物功能基因知多少 | 微生物专题

功能基因篇：微生物碳循环功能基因怎么玩？快来围观！| 微生物专题

功能基因篇：一文带你了解氮循环功能基因 | 微生物专题

用户文章连着发（节选）

10分项目文章：不做机制，也能出高分文章 | 微生物专题

8分+项目文章：除了肠道菌群，这里的菌群也大有可为！| 微生物专题

这个选题思路来自10分和8分的肿瘤菌群项目文章 | 微生物专题

一作分享土壤学顶刊发文经验：改良剂对土壤ARGs丰度和菌群结构的影响 | 微生物专题

8月：7篇微生物项目文章发表，1篇登上土壤学顶刊SBB | 微生物专题

用户文章 | 宁波大学高产课题组2019年文章揭秘

专访宁波大学高产课题组，发文经验大揭秘

【4连发-1】VB12对乳清蛋白保护作用的稳定性及其对肠道微生物的影响 | 用户文章

【4连发-2】VB12在体外结肠模拟中诱导微生物组成和代谢活动的转变 | 用户文章

【4连发-3】罗氏乳杆菌对腐乳发酵过程中维生素B12含量和微生物群组成的影响 | 用户文章

【4连发-4】氰钴胺和甲钴胺对炎性肠病和肠道微生物组成的影响 | 用户文章

客户文章：16S+代谢组炼就8分肠道菌群文章 | 微生物专题

肠道微生物对花生四烯酸性别依赖性肥胖的影响

木糖醇通过肠道微生物群的交叉喂养增强结肠中丙酸的合成 | 微生物专题

红景天甙对呋喃导致的肝损伤小鼠肠道微生物群的改善作用【用户文章】

人类正常眼球表面的真菌特征 | 用户文章

山东省眼科研究所黄钰森组：人类眼结膜微生物群落新发现

药用植物丹参种子的核心微生物组研究

华东常绿阔叶林土壤细菌群落变化研究

【用户文章】微生物专题 | 环境治疗与微生物研究更配哦

不同降温策略下混合硝化细菌的硝化性能，活性和群落动态研究

用户文章 | 石河子大学鲁建江组：PM1和PM10中微生物群落分析

【用户案例】长江口潮间带微塑料相关微生物群落研究 | 微生物

微生物组用户ISME文章：宿主性别可以决定肠道微生物对寄生虫感染的响应 | 微生物专题

用户文章断奶改变猪的肠道微生物区系进而调节肠道中营养代谢相关的基因表达 | 微生物专题

用户文章垂直流人工湿地中抗生素和氮的同时去除：基质的影响和微生物功能的响应

客户文章：白藜芦醇改善断奶仔猪的腹泻和肠道炎症的原因

朱炫组肠道微生物组研究又4连发，1篇登Microbiome

用户文章|IF=11.62，微生物组+代谢组经典组合揭示肥胖成人肠道微生物代谢物的变化-代谢组学专题

用户文章∣代谢组+微生物揭示中国地方性骨关节炎大骨节病患者肠道菌群和代谢物的变化-代谢组学专题

微生物组数据分析就用云平台

联川生物云平台使用指南【新】

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云平台 (12) | NCBI-SRA数据上传指南

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扩增子云分析即将上线，还不知道怎么使用的小伙伴看过来！

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微生物组服务升级

五项更新！更容易上手的宏基因组测序报告出炉 | 微生物专题

报告一下，我们是这样做微生物组测序实验的

喜报！合作课题组又发表8篇微生物组文章

微生物组16S测序又有大动作！升级至NovaSeq PE250，数据量免费升至5万Tags

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口腔菌群研究怎么做

做口腔菌群研究，你还缺少什么？

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这有一份口腔菌群研究攻略，请查收 | 微生物专题

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全长16S鉴定菌群到种

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血液微生物组

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系统性红斑狼疮患者与健康个体中存在不同的血浆微生物| 血液微生物组

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