| 前言 | 应用单细胞组学工具于生物系统研究，可以帮助我们深入了解不同细胞群体的多样性以及它们对内部和外部扰动的异质性反应。然而，到目前为止，植物系统的单细胞研究大多局限于 RNA 测序方法，这只能提供细胞功能的间接读数。 |
本研究提出了一种适用于植物细胞的单细胞蛋白质组学工作流程，该方法整合了胶带夹层原生体制备、压电细胞分选、nanoPOTS 样品制备以及基于 FAIMS 的质谱数据采集方法，用于拟南芥叶肉细胞的无标记单细胞蛋白质组学分析。
通过该方法，从单个叶肉细胞原生体中可以高精度定量超过 3,000 种蛋白质。研究人员利用该工作流程分析了超过 80 个来自水充足和缺水胁迫胁迫植株的原生体，从而鉴定出胁迫相关蛋白质丰度变化。
此外，本文还描述了一种构建单细胞水平共变蛋白网络的新方法，并展示了单细胞蛋白共变分析如何揭示以前未知的蛋白质功能，同时捕获胁迫诱导的蛋白质-蛋白质动态变化。
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