前言 | 拟南芥基因表达受到超过 1900 个转录因子 (TF) 的调控,这些转录因子通过基因组范围内存在良好保守的 DNA 结合域得以识别。 激活型转录因子含有激活域 (AD),可招募共激活物复合体;然而,对于几乎所有拟南芥转录因子,我们都缺乏对其激活域的位置和转录强度的相关信息。 |
为了解决这一缺口,Morffy et al 在这项研究中使用酵母菌文库方法在蛋白质组范围内实验性地鉴定拟南芥激活域,并发现一半以上的拟南芥转录因子包含激活域。
Morffy et al 注释了 1553 个激活域,据我们所知,绝大多数激活域以前未知。利用生成的数据集,作者开发了一个神经网络,可以准确预测激活域并识别招募共激活物复合体所必需的序列特征。
作者揭示了六种不同的序列特征组合可导致激活活性,为研究激活域的功能亚化提供了一个框架。此外,作者还在古老的 auxin 响应因子 (ARF) 转录因子家族中发现了激活域,这表明激活域定位在不同的进化枝中是保守的。
本文的研究结果为理解转录激活提供了重要资源,为检查本质无序区的功能和激活域的预测模型建立了框架。
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