前言 | 过氧化氢 (H2O2) 是植物细胞在正常生长发育过程中自然产生的物质,它充当信使分子,调节细胞代谢。 尽管过氧化氢很重要,但其与雷帕霉素靶蛋白 (TOR) 通路的关系及其对细胞分裂的影响却鮮少被研究。 |
本研究探索了过氧化氢与 TOR 的相互作用,TOR 是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在控制拟南芥 (Arabidopsis thaliana) 的细胞生长、大小和代谢方面起着核心作用。
作者通过两种浓度 (0.5 和 1 mM) 的外源过氧化氢处理,可以将发育特征(例如主根生长、侧根形成和鲜重)与细胞周期基因 CYCB1;1 的表达以及 TOR 表达联系起来。评估与核糖体生物合成相关的基因 RPS27B 的表达时,暴露于 1 mM 过氧化氢处理后其表达增加了 94.34%。这种增加被 TOR 抑制剂 torin 2 抑制。用抗坏血酸 (AA) 消除过氧化氢积累会导致细胞分裂和 TOR 表达降低。
结果讨论了过氧化氢影响根部细胞周期和 TOR 表达的潜在分子机制。
开始排雷:
唯一的可靠信息:H2O2影响TOR的转录水平!但分子机制不明!
RPS27B 作为 TOR 激活核糖体的证据不足: 作者认为 H2O2 激活了整个 TOR 通路,但缺乏强有力的证据支持 RPS27B 可以作为 TOR 激活核糖体生物genesis 的标记。其他研究组应该谨慎使用该方法来检测 TOR 通路的激活。
CycB1;1-GUS 不是细胞分裂活性的准确标记: 文章使用 CycB1;1启动子-GUS 报告细胞周期基因的转录调控,但它并不能准确反映“分裂中的细胞数量”。尤其是当它作为转录报告基因时,还需要考虑 TOR-YAK1 通路对 CDKs 的影响 (Forzani et al., Cell Reports, 2019) 和 TOR-4EBP2 通路对 CycB1;1 翻译的影响 (Dong et al., Cell Reports, 2023)。
Torin 浓度可能过高: 文中使用的 Torin 浓度 (25 uM) 可能对拟南芥有些过高,导致了比预期更强的抑制作用。虽然这个浓度参考了 Li et al., PNAS, 2017,但过高的浓度严重影响了我们对其生理意义的判断!其他研究组在使用 Torin 进行类似实验时应该注意这一点,并选择合适的浓度。
更多信息:www.ikannediting.com
邮件地址:ikann-editing@outlook.com
原创深度解析:移动mRNA,双链RNA受体,蛋白翻译参与的植物免疫,TOR信号与再生,CaMV,TOR与光信号,TOR与RNA可变剪切,
客户文章精选:TOR-4EBP,荔枝脱落,CUCUME数据库,伴侣蛋白辅助RNP运输,二价染色质与环境响应。
原创锐评:Science子刊错误的数据分析,Nature糟糕的审稿,Elsevier的贪婪,经常被忽略的植物学研究,顶刊忽视预印,拉大牛入伙,科研评价体系,一稿多投,让人失望的Plant Journal,Current Biology发文良莠不齐。
写作指导:标题,cover letter,摘要,图和图注,讨论,回复审稿人,润色。