泛基因家族分析是基于物种泛基因组序列信息去进行家族成员鉴定及分析的新方法，能很好地弥补单一参考基因组无法全面代表整个物种的全部遗传变异信息的不足，是进行基因家族分析的新方法新思路。与传统基因家族分析相比具有以下3个优势：
泛基因家族成员的鉴定； 泛基因家族成员在各品系中的缺失分析； 泛基因家族成员的系统发育分析； 泛基因家族成员选择压力分析； 泛基因家族成员结构变异的注释； 泛基因家族成员结构变异对其转录表达的影响分析 泛基因家族成员结构变异对其基因结构及保守结构域的影响分析 差异表达基因家族成员转录因子互作网络分析
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