前言 | 水稻是植物生物学中最重要的粮食作物和模式物种之一,但其蛋白质组定量信息尚不清楚。 |
在这项研究中,Li et al 使用串联质谱标记策略结合深度分级和质谱分析,对水稻主要组织中超过 15,000 个基因的相对蛋白质水平进行量化。
Li et al 鉴定出与个体组织功能特异性相关的组织特异性和组织富集蛋白。水稻和拟南芥的蛋白质组基因组比较揭示了保守的蛋白质组表达,这不同于哺乳动物,后者存在明显的物种而非组织差异。
值得注意的是,水稻主要组织中 N6-甲基腺苷 (m6A) 的谱分析表明,非翻译区的 m6A 与蛋白质丰度呈负相关,并导致 RNA 和蛋白质水平的不一致。这项研究还发现了 MED18 是影响植物体内 N6-甲基腺苷修饰的全新调控因子。
本文的数据对于识别调节 m6A 甲基化所需的新型基因具有重要价值。总而言之,本研究为进一步研究水稻蛋白质组基因组提供了范例。
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