1、小规模纳税人3%的普票。普票不能作为增值税进项税抵扣，入账时，增值税额与货款一并计入初始入库成本。
2、简易计税3%增值税专票。以发票记载货款金额为基础，按9%税率进行抵扣。
3、一般纳税人13%的专票。按发票记载的增值税税额作为增值税进项税额扣除。
4、农产品收购发票。以收购价格作为基数，按9%税率作为进项税扣除。
5、农贸市场免税发票。农贸市场的免税发票，发票记载增值税税额为零，无法作为进项税进行扣除。
情形一：小规模纳税人开具普票（税率3%）
例1：甲企业是一般纳税人，以销售、加工农产品为主业，2023年8月从农产品经销商（小规模）处购买农产品，取得了一张3%的增值税普通发票，货款1万，增值税款0.03万。农产品已经入库，款项已经支付。甲公司分录如下：
借：原材料—XX产品 10300
贷：银行存款 10300
说明：实际农产品的账务处理中，开具普票对于收货方税款损失极大，基本不会有小规模纳税人开具普票，售卖农产品。
情形二：小规模纳税人开具增值税专用发票（税率3%）
计算进项税= 价税合计（发票价格）÷（1+3%）×9%
法律依据：《财政部 国家税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》（财税〔2017〕37号）第二条规定，从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额；取得(开具)农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
例2：甲企业是一般纳税人，以销售、加工农产品为主业，2023年8月从农产品经销商（小规模）处购买农产品，取得了一张3%的增值税专用发票，货款1万，增值税款0.03万。农产品已经入库，款项已经支付。甲公司账务处理如下：
1、计算本次购买进项税
进项税额=10300÷（1+3%）×9%=900元
2、会计分录
借：原材料—xx 9400 （1030-900）
应交税费-应交增值税-进项税额 900
贷：银行存款 10300
情形三：获得一般纳税人增值税专用发票
例3：甲企业是一般纳税人，2023年8月份从乙企业（一般纳税人）购买非免税农产品，货款10万，增值税款1.3万。农产品已经入库，款项已经支付。甲公司账务处理如下：
借：原材料 100000
应交税费-应交增值税-进项税额 13000
贷：银行存款 113000
情形四：开具农产品收购发票
例4：甲企业是一般纳税人，2023年8月2号份从自然人购买农产品，支付货款10万，当日去当地税务机关开具农产品收购发票。农产品已经入库，款项已经支付。甲公司账务处理如下：
1、计算进项税
进项税=收购价×9%=10万×9=9000
2、会计分录
借：原材料 91000
应交税费-应交增值税-进项税额 9000
贷：银行存款100000
情形五：农贸市场开具的免税发票
例5:乙餐饮企业，为一般纳税人。8月份从农贸市场处进货货款10万，农贸市场对其开具免增值税发票，乙餐饮企业该笔业务的账务处理。
借：原材料 10万
贷：银行存款 10万
说明：免税增值税发票，由于没有增值税，只能作为企业所得税的税前扣除凭证，对增值税税费减少无作用。
1、直接销售农产品
直接销售农产品的进项税扣除，按照销量来，通过差额法来计算可抵扣额度。计算公式如下：
当期允许抵扣农产品增值税进项税额＝当期销售农产品数量/（1－损耗率）×农产品平均购买单价×扣除率
例6：甲企业以销售农产品为主业，销售农产品适用9%税率。7月份收购农产品8吨，共价款10万，销售农产品4吨，价款15万。7月初无库存，产品损耗率20%。计算甲企业7月份应交增值税额。
当期允许抵扣农产品增值税进项税额=4÷（1-20%）×（100000÷8）×9%=5625
当期销项税额=15×9%=13500
当期应交增值税=当期销项税 — 当期允许抵扣农产品增值税进项税额=13500-5625=7,875
2、农产品不构成货物实体的加工企业
农产品加工后，生产出的商品，农产品并不构成新产品的实体。其农产品需要按消耗量来确认可抵扣增值税金额，计算公式：
当期允许抵扣农产品增值税进项税额＝当期耗用农产品数量×农产品平均购买单价×扣除率/（1+扣除率）
