文章标题：Elucidating the causal nexus between antibody-mediated immunity and autoimmune diseases: Insights from bidirectional mendelian randomization, gene expression profiling, and drug sensitivity analysis
中文标题：阐明抗体介导的免疫与自身免疫性疾病之间的因果关系：来自双向孟德尔随机化、基因表达分析和药物敏感性分析的见解
发表期刊：International Immunopharmacology
发表时间：2024年8月
影响因子：4.8/Q1
自身免疫性疾病例如 Graves 病、类风湿性关节炎、1 型糖尿病和强直性脊柱炎，包括多种疾病。自身免疫的过程很复杂，受遗传和环境因素的影响。但自身免疫性疾病的确切原因尚不清楚。
研究方法
我们选择了46 种抗体的数据来自全基因组关联研究 （GWAS）。自身免疫性疾病数据来自 FinnGen 联盟和 IEU OpenGWAS 项目。逆方差加权 （IVW） 分析是主要方法，辅以异质性和敏感性分析。我们还检查了显著 SNP 附近的基因表达并进行了药物敏感性分析。
结果分析
1.抗体对自身免疫性疾病的因果影响
在对 15 种自身免疫性疾病的 46 种抗体的分析中，我们发现 30 种抗体会影响 15 种自身免疫性疾病。其中，18 种抗体与 13 种疾病呈正相关，而 19 种抗体与 15 种疾病呈负相关。
2. 抗体对自身免疫性疾病的影响
水痘带状疱疹病毒糖蛋白 E 和 I 抗体水平显著增加了 AH 的风险，幽门螺杆菌 OMP 抗体水平增加了 PV 的风险。
3.自身免疫性疾病对抗体的随机分析
8 种自身免疫性疾病与 14 种抗体呈正相关，而 12 种自身免疫性疾病与 24 种抗体呈负相关。IBD 和 MG 分别与抗 EB 病毒 IgG 血清阳性和幽门螺杆菌 VacA 抗体水平呈负相关。AS 与 5 种抗体呈正相关。CD 和 Graves 病均与两种抗体呈负相关。RA 显示与 6 种抗体呈负相关。银屑病和 SLE 均与 2 种抗体呈正相关，与 1 种抗体呈负相关。AH 与 2 种抗体呈负相关，与 1 种抗体呈正相关。MS 与 4 个抗体呈负相关，与 1 个抗体呈正相关。PSC 显示与 5 种抗体呈负相关，与 2 种抗体呈阳性相关。T1D 与 5 个抗体呈负相关，与 3 个抗体呈正相关。UC 显示与 3 种抗体呈负相关，与 3 种抗体呈正相关。
4.抗体和 AS 之间的影响
人疱疹病毒 6 IE1B 抗体和水痘带状疱疹病毒糖蛋白 E 和 I 抗体对 AS 有影响。
5.AS 中的基因表达谱
Agilent mRNA 微阵列分析中检测到 15 个基因，只有两个基因表现出显著的差异表达 （POM121L2，p 值 = 0.013;KIAA1456，p 值 = 0.014）。在 GSE25101 中，两个基因表现出统计学上的显著差异 （BTN3A1，p 值 = 0.036;AIF1，p 值 = 0.001）。在 GSE73754 中，两个基因的表达显著增加 （TRIM27，p 值 = 0.002;SCGN，p 值 = 0.003）。
6.AS 中的药物敏感性分析
AIF1 、MUC16 、GSE1 、BTN3A1 、TRIM27 、HIST1H4D 和 KIAA1456 与多种药物显著相关，在已确定的药物中，排名前十的候选药物包括奈拉滨、白屈菜红碱、扎西他滨、PF-04217903、蒿甲醚、羟基脲、甲泼尼龙、金鸡定、环磷酰胺和伊莫森，其中一些已经用于 AS 治疗方案。
文章小结
我们通过双向 MR 分析证实了各种抗体与自身免疫性疾病之间的复杂因果关系，揭示了感染后抗体相互作用的复杂模式。几种药物和基因，尤其是 AIF1，显示出作为 AS 治疗候选药物的潜力，为研究提供了新的途径。（如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣，但时间和精力有限或者缺乏相关经验，lulu非常乐意为您提供如下服务：免费思路评估、付费方案设计和生信分析等，有意向的老师欢迎联系lulu！）
