7.5/Q1,安徽医科大学第一附属医院孟德尔随机化大揭秘:系统性红斑狼疮和常见女性激素依赖性恶性肿瘤的跨种族研究

文摘   2024-10-08 18:10   海南  

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文章标题:Trans-ethnic Mendelian randomization study of systemic lupus erythematosus and common female hormone-dependent malignancies 

中文标题:系统性红斑狼疮和常见女性激素依赖性恶性肿瘤的跨种族孟德尔随机化研究

发表期刊:Chin Med J

发表时间:2023年11月

影响因子:7.5/Q1

研究背景
观察性研究报告称,系统性红斑狼疮 (SLE) 与常见的女性激素依赖性癌症有关,但潜在的致病影响仍未确定。本研究旨在通过孟德尔随机化 (MR) 分析探讨这些情况的因果关系。

研究方法

从欧洲和东亚人群中进行的全基因组关联研究 (GWAS) 中选择SLE的工具变量。女性恶性肿瘤的遗传变异来自相应的祖先 GWASs。我们使用逆方差加权 (IVW) 作为主要分析,然后进行敏感性分析。此外,我们进行了多变量 MR (MVMR),通过调整体重指数和雌二醇来估计直接影响。最后,我们实施了反向 MR 分析,并给出了一个反例来检验 MR 结果的可靠性。

结果分析

1. 参与者的特征和 IV

从系统性红斑狼疮(SLE)GWAS 数据集中选取 45 个独立 SNP 作为工具变量,用于预测 SLE 与欧洲人女性恶性肿瘤风险的关联,其最小 F 统计量符合强仪器定义临界值。在这些 IV 中,从子宫内膜癌、乳腺癌和卵巢癌 GWAS 提取数据。对于东亚人,从 SLE 摘要数据中提取 40 个独立 SNP,其中 37 个符合条件的 SNP 用于后续分析,并从三种癌症汇总估计中提取特定数量的全基因组显著 SNP,表中总结了各结果中可用的 IV 数量 GWAS。

2.欧洲人群的双样本 MR 结果

IVW 结果表明系统性红斑狼疮(SLE)可能对降低总体子宫内膜癌风险有因果效应,MR-PRESSO 模型和加权中位数也予以证实,虽 MR-Egger 和加权模式模型结果不显著但方向一致。将子宫内膜癌按组织学分类后,SLE 与 ENEC 风险降低有提示相关性,其他方法虽不显著但也呈负相关,且用散点图展示了 SNP 关联。遗憾的是,未发现 SLE 与其他研究癌症有重要因果关系。

3. 东亚人的双样本 MR 结果

IVW 结果显示系统性红斑狼疮(SLE)可能与乳腺癌风险降低相关,这一结果在 MR-PRESSO 和加权中位数模型中得到确认,加权模式模型也表明中度负相关。虽 MR-Egger 结果无统计学意义,但效果方向与其他模型相同。还创建了散点图描述 SNP 对 SLE 与 SNP 对乳腺癌的影响关联。未发现 SLE 与东亚人患子宫内膜癌和卵巢癌的风险有显著因果关系。

4. MR 敏感性分析和统计功效结果

为确定 MR 结果中是否存在异质性和多效性进行了一组敏感性分析。MR-Egger 截距试验所有 P 多效性>0.05,表明全基因组 IV 无显著水平多效性,对称漏斗图也支持该结论。还用 MR-PRESSO 模型验证水平多效性影响,结果表明水平多效性不影响 SLE 与癌症的因果估计。单个 SNP 分析和留一法分析表明因果估计不受单个 SNP 影响。MR 分析的统计功效显示 SLE 与欧洲子宫内膜癌 ENEC 以及东亚乳腺癌之间的因果关联功效>0.9。

5. MVMR 结果

在欧洲人群中调整 BMI 和雌二醇后,系统性红斑狼疮(SLE)对降低总体子宫内膜癌风险的因果效应依然很强,对降低 ENEC 风险也有显著提示作用。在东亚人中去除雌二醇相关工具变量并调整 BMI 后,SLE 与乳腺癌风险之间的负相关仍然显著。在多变量孟德尔随机化(MVMR)结果中,没有显著证据支持 SLE 与其余研究癌症之间存在因果关系。

文章小结

本研究通过MR分析, 发现SLE可能与欧洲子宫内膜癌和东亚乳腺癌风险降低有因果关系,并暗示SLE与欧洲人群 ENEC 风险降低呈中度相关。这些发现为 SLE 患者常见的女性激素依赖性恶性肿瘤及其亚型风险提供了客观证据。(如果你正寻求思路复现、实验设计或定制化的数据分析服务,那么请不要错过我们哟~)

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