5.7/Q1,南京医科大学附属第二医院+孟德尔随机化+GWAS 确定了强直性脊柱炎的治疗靶点

文摘   2024-09-11 18:30   海南  

今天为大家分享的文章亮点在于运用了单细胞测序和转录组分析进行研究,轻松20+,文章思路十分值得学习和借鉴,对文章感兴趣的老师,欢迎扫码关注lulu

文章标题:Proteome-wide Mendelian randomization identifies therapeutic targets for ankylosing spondylitis

中文标题:白质组范围的孟德尔随机化确定了强直性脊柱炎的治疗靶点

发表期刊:Frontiers in Immunology

发表时间:2024年3月

影响因子:5.7/Q1

研究背景

强直性脊柱炎 (AS) 是一种慢性炎症性疾病,可导致相当大的疼痛和残疾。孟德尔随机化 (MR) 已广泛用于重新利用许可药物和发现新的治疗靶点。我们的目标是确定 AS 的创新治疗性蛋白质靶点,并评估可成药蛋白的潜在不良反应。

研究方法

我们通过蛋白质组范围 MR 研究,以评估血浆蛋白与 AS 风险之间的因果关系。血浆蛋白来源于英国生物样本库制药蛋白质组学项目 (UKB-PPP) 数据库,包括 2,940 种血浆蛋白的 GWAS 数据。进行共定位分析以确定血浆蛋白和 AS 之间共有的因果变异。最后,我们利用 R9 版中广泛的芬兰数据库进行表型组范围关联研究 (PheWAS)。

结果分析

1.与 AS 相关的血浆蛋白

六种血浆蛋白 TNF (肿瘤坏死因子)、FKBPL 、AGER 、NFKB1 、ALDH5A1 和 GPIHBP1与 AS 呈正遗传关联。AIF1 (同种异体移植物炎症因子 1) 和 ACOT13 (酰基辅酶 A 硫酯酶 13) — 与 AS 呈负因果关联。

2. AS 相关血浆蛋白的敏感性分析

AIF1 、 TNF 、 FKBPL 、 AGER、 ALDH5A 和 ACOT13 这 6 种血浆蛋白可能是治疗 AS 的潜在靶点。

3.与 AS 相关的 6 种血浆蛋白的表型组范围关联分析

AIF1 与 18 个类别的 36 个表型 、TNF 和 16 个类别的 40 个表型、FKBPL 和 18 个类别的 73 个表型 、AGER 和 11 个类别的 16 个表型 、ALDH5A1 和 3 个类别的 3 个表型  以及 4 个类别的 ACOT13 和 6 表型 可能是治疗对象或对靶蛋白的有害影响。

文章小结

我们发现6 种蛋白的预测血浆水平与 AS 风险升高之间存在正遗传关联,而 2 种蛋白与 AS 风险呈负相关 。在这 8 种血浆蛋白中, AIF1 、 TNF 、 FKBPL 、 AGER 、 ALDH5A1 和 ACOT13 6种蛋白为 AS 的治疗提供了新的靶点。(对文章思路和方法感兴趣的老师,欢迎扫码关注lulu一起交流)

生信Rhim
生信Rhim,持续更新风湿免疫科风湿性关节炎,系统性红斑狼疮,强直性脊柱炎,骨关节炎,痛风等疾病的临床生信前沿文献和思路,提供专业的生信分析服务:思路设计,生信分析,文献复现,科室科研培训,数据库搭建,全力助力您的科研之路!
 最新文章