7.5/Q1,高维分析+转录组+建模破译细胞在炎症性关节炎中的作用

文摘   2024-08-27 21:16   陕西  

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文章标题:Psoriatic and rheumatoid arthritis joints differ in the composition of CD8+ tissue-resident memory T cell subsets

中文标题:银屑病关节炎和类风湿关节炎关节的 CD8+ 组织驻留记忆 T 细胞亚群的组成不同

发表期刊:Cell Reports

发表时间:2016年7月

影响因子:7.5/Q1

研究背景

银屑病关节炎 (PsA) 和类风湿性关节炎 (RA) 是最常见的炎症性关节炎类型,它们经常导致严重的残疾和生活质量下降。滑膜关节的炎症是这两种疾病的关键特征,PsA和RA对靶向治疗的反应不同。尽管有效治疗取得了重大进展,但这两种疾病都呈慢性病程,疾病复发和无药物延长缓解状态的频率较低。目前没有专门针对仅存在于发炎组织中的细胞的治疗方法。对驱动慢性关节炎症的细胞或因素的了解的提高将为转向关节靶向治疗奠定新的基础,通过抑制驱动持续性疾病的途径来阻止关节炎的发展或进展。组织驻留记忆 T 细胞 (T马币细胞),可能为驱动慢性免疫介导的炎症性疾病的机制提供关键见解。

究方法

T马币 细胞存在于炎症性关节炎患者的发炎关节中,但这些细胞在 PsA 和 RA 之间在数量、表型和/或功能上存在差异。使用高维分析 (CyTOF 和单细胞 RNA测序 [scRNA-seq]),我们对 PsA 中滑液 CD8 + 和 CD4 + CD69 + CD103 + T 细胞进行了定量和定性分析,具有促炎细胞因子谱和独特的转录组特征。此外,克隆性分析揭示了PsA 患者滑膜 17 型样 CD8+CD69+CD103+ T 细胞和 CD8+CD103− T 细胞的多克隆但不同的 T细胞受体 (TCR) 库。

结果分析

1. CD8 + CD69 + CD103 + T 的多个群体马币与 RA 相比,PsA 患者滑液中的细胞富集

大多数滑膜 CD8+ 和 CD4+ T 细胞表达高水平的 CD69,这很可能反映了这种炎症环境中 T 细胞活化的状态,而不是将这些细胞识别为 CD69+CD103− T马币细胞。使用 FlowSOM 和 ConsensusClusterPlus 软件包通过无监督聚类进行细胞群鉴定,这些软件包在所有患者样本中将 CD8+ 和 CD4+ T 细胞分解为15 个簇,每个细胞群具有不同的表达谱 。

识别这些簇的特征,我们进行了标记富集建模 (MEM) 分析量化亚群特异性、阳性和阴性标记物富集。

2. 滑膜 CD8+CD69+CD103+ T 的细胞因子表达谱马币细胞群

PMA/离子霉素大大增加了大多数细胞中 CD69 的表达,与 RA 相比,在 PsA 患者的滑膜 CD8+ T 细胞中观察到更高的 CD103 表达和 CD103+ 细胞的频率增加,CD8+ T 的 MEM 分析马币簇揭示了不同的细胞因子特征,在这 5 个 T 中,其他检测细胞因子(IL-4、IL-6、IL-10、IL-17F、IL-21、IL-22、GM-CSF 和 TGFβ)的表达相对较低马币簇,尽管一些 PsA T马币与 RA 对应物相比,簇表现出更高的表达水平。

3. 滑膜 CD8+CD69+CD103+ T马币来自 PsA 患者的细胞是多克隆的,与 CD8+CD103− T 细胞几乎没有克隆相似性

估滑膜 CD8+CD69+CD103+ T 克隆性CD8+CD103 T 细胞,我们使用 VDJ 测序并将配对的 α/β TCR 序列映射到相同细胞的基因表达。来自 PsA 患者的SF 衍生的 CD8+ T 细胞通常表现出多克隆库,对于 17型样 T 细胞具有更明显的库马币细胞。

4. PsA 患者的滑膜 CD8+CD103− T 细胞也显示出普遍的 17 型样表型

在 FlowSOM 和ConsensusClusterPlus 识别的集群中,我们发现在 CD8+CD103− T 细胞中,第 9 簇和第 10 簇在 PsA 患者中显著富集,而簇 2 在RA 患者中显著富集在 CD4+CD103− T 细胞中,第 1 簇和第 4 簇在 PsA 患者中显著富集,而簇 5、6 和 9 在 RA 患者中显著富集。

文章小结

CD69+CD103+ 组织驻留记忆T (T马币) 细胞是炎症的重要驱动因素。为了破译它们在炎症性关节炎中的作用,我们对银屑病关节炎 (PsA) 或类风湿性关节炎 (RA) 患者关节的 T 细胞进行了单细胞、高维分析。我们确定了三组滑膜CD8+CD69+CD103+T 细胞具有不同的转录组特征和多克隆但不同的 TCR 库。与 RA 相比,17 型样细胞在 PsA 中也富含 CD8+CD103− T 细胞。这些发现说明了 PsA 和 RA 免疫病理学的差异,特别是 PsA 关节中 17 型 CD8+ T细胞的富集。对这篇文章的思路感兴趣的老师,欢迎扫码咨询!

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