6.1/Q1,空气污染引发这么多疾病!中南大学湘雅医院+孟德尔随机化+TWAS揭示空气污染物与自身免疫性疾病之间的因果关系

文摘   2024-09-09 18:30   海南  
今天为大家分享的文章亮点在于运用了孟德尔随机化、TWAS等方法进行空气污染与自身免疫疾病之间关系的研究,运用方法和文章思路十分值得学习和借鉴。对文章感兴趣的老师,欢迎关注lulu一起交流!

文章标题:Large-scale genome-wide association studies reveal the genetic causal etiology between air pollutants and autoimmune diseases

中文标题:大规模全基因组关联研究揭示了空气污染物与自身免疫性疾病之间的遗传因果病因

发表期刊:Journal of Translational Medicine

发表时间:2024年4月

影响因子:6.1/Q1

研究背景

流行病学证据表明,长期暴露于空气污染物与自身免疫性疾病之间存在密切关联,而因果关系仍然未知。

究方法

双样本孟德尔随机化 (TSMR) 用于研究 PM10 、 PM2.5 、 NO 的作用2和 NOX 在 15 种自身免疫性疾病 。进行多变量孟德尔随机化 (MVMR) 以研究每种空气污染物的直接影响以及共同因素的中介作用,包括体重指数 (BMI) 、饮酒量、吸烟状况和家庭收入。进行全转录组关联研究 (TWAS) 、两步 MR 和共定位分析,以探讨空气污染与自身免疫性疾病之间的潜在机制。

结果分析

1. 空气污染物对自身免疫性疾病的因果影响

四种 AD 的风险与较高的空气污染物暴露量显著相关,包括甲状腺功能减退症、UC、RA 和 SLE, SS 和 AA 的风险与较高的 NO 暴露量相关。甲状腺功能亢进症、 MS、 CD、 T1D、AS 、 IBS 、 银屑病和 PSC 与暴露于 TSMR 中的任何空气污染物均无相关性。

2. 空气污染和自身免疫性疾病之间可能的中介因素

潜在的中介因素(BMI、吸烟、酒精和收入)与空气污染物一起包含在 MVMR 中, MVMR 中的空气污染物和 AD 之间仍然存在几个很强的关联。

3. 确定空气污染物和自身免疫性疾病的常见富集途径

71 、 68 、 70 和 40 个常见基因在自身免疫性疾病和 NO 中表达,与 NO 相关的富集通路X、PM2.5 和 PM10 分别在同一方向上,表现在代谢过程、免疫活性、表观遗传和转录组调控中。

4.鉴定从空气污染物介导到自身免疫性疾病的蛋白质和共定位分析

 POR、HSPA1B、SHANK3 和 BRD2 可能发挥空气污染物对自身免疫性疾病风险增加的中介作用。

文章小结

本文从最新的大规模 GWAS 获得的单核苷酸多态性,强有力的证据表明空气污染物与自身免疫性疾病(甲状腺功能减退症、溃疡性结肠炎、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、乳糜泻)之间存在因果关系。(对文章思路和应用方法感兴趣的老师,欢迎关注lulu一起交流)

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