9.7/Q1,上海交通大学医学院孟德尔+SMR+共定位药靶确定抗糖尿病药物在治疗骨关节炎中具有潜在作用

文摘   2024-10-05 17:30   海南  

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文章标题:Exploring antidiabetic drug targets as potential disease-modifying agents in osteoarthritis

中文标题:探索抗糖尿病药物靶点作为骨关节炎的潜在疾病调节剂

发表期刊eBioMedicine

发表时间2024年9月

影响因子9.7/Q1

研究背景

骨关节炎是导致残疾的主要原因,而改善病情的骨关节炎药物 (DMOAD) 可能代表治疗的关键进步。确定抗糖尿病药物作为 DMOAD 的潜力可能会显著影响患者护理。

究方法

研究团队设计了一个综合分析流程,包括双样本孟德尔随机化(MR,用于抗糖尿病药物靶点的遗传代理)、基于汇总的MR(SMR,用于mRNA)和共定位分析(用于药物-靶基因),以评估这些靶点与12种骨关节炎表型的因果关系。利用了来自骨关节炎最大的全基因组关联荟萃分析 (GWAS) 的汇总统计数据和来自 eQTLGen 联盟的基因表达数据。

结果分析

1. MR 基因确定的抗糖尿病药物靶点对骨关节炎的影响

在 IVW(随机效应)、敏感性分析 (固定效应 IVW、加权中位数和加权模式法) 和 MR 质量控制后发现,除了 GANC 、 KCNJ8/ABCC9 和 SLC5A2 外,有 11 个重要的药物靶点与 MR 分析中的至少一种骨关节炎表型相关。


2. 抗糖尿病药物靶向基因表达和骨关节炎

在随后的主要的SMR分析中,研究团队发现抗糖尿病药物靶向的 eQTLGen 中 KCNJ11 、 CPT1A 、 PPARD 、 IGF1R 和 GANAB 的基因表达与至少一种骨关节炎表型显著相关。


3. SMR 分析

KCNJ11、GANAB、ABCA1 和 GSTP1 在至少两个基因表达数据集中复制,包括 eQTLGen(血液)、PsychENCODE(大脑)和 GTEx(骨骼肌)。KCNJ11 和 GANAB 在所有三个数据集中一致复制。

4. 推定蛋白与骨关节炎的共定位

结果显示抗糖尿病药物靶向的KCNJ11、ESRRA、RXRB、INSR 和 GANAB 至少与一种骨关节炎表型(PPH4 >0.8)显著相关,并至少两个基因在表达数据集上重复。具体来说,KCNJ11表达增加与骨关节炎风险降低相关,并且与至少一种骨关节炎表型共定位。

文章小结

研究结果表明,抗糖尿病药物在治疗骨关节炎方面具有潜在的治疗作用。结果表明,某些抗糖尿病药物靶点可能会改变疾病进展,对开发靶向 DMOAD 具有重要意义。如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣,但时间和精力有限或者缺乏相关经验,小骨非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费方案设计生信分析等,有意向的老师欢迎联系小骨哦!

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