Cytoscape是一个用于可视化复杂网络并可以将这些网络与任何类型的属性数据集成的软件平台。它在生物信息学、社会网络分析和其他领域被广泛使用。以下是在Cytoscape中添加节点和边的方法（可参见以下视频）：
添加节点
1. 打开Cytoscape：如果还没有打开，启动Cytoscape。
2. 创建新网络：
- 选择 `文件(File)` > `新建(New)...` > `网络(Network)`。
- 将创建一个新的、空的网络。
3. 添加节点：
- 在工具栏中点击 `节点(Node)` 工具（看起来像一个圆圈）。
- 在网络面板中任意位置点击以创建一个新节点。
- 要添加多个节点，按住 `Shift` 键并点击以创建更多节点。
4. 编辑节点属性（可选）：
- 通过点击选择你想要编辑的节点。
- 选择 `节点(Node)` > `编辑(Edit)...` 或者双击节点。
- 在 `节点编辑器(Node Editor)` 对话框中，你可以更改节点的名称、形状、颜色、大小和其他属性。
添加边
1. 选择边工具：
- 点击工具栏中的 `边(Edge)` 工具（看起来像一条带箭头的线）。
2. 创建边：
- 点击源节点并拖动鼠标到目标节点以在它们之间创建一条边。
- 释放鼠标按钮以完成边的创建。
3. 编辑边属性（可选）：
- 通过点击选择你想要编辑的边。
- 选择 `边(Edge)` > `编辑(Edit)...` 或者双击边。
- 在 `边编辑器(Edge Editor)` 对话框中，你可以更改边的名称、线型、颜色、宽度和其他属性。
导入节点和边
如果你有现有数据，可以将节点和边导入Cytoscape：
1. 从表格或电子表格导入：
- 选择 `文件(File)` > `导入(Import)...` > `表格/电子表格(Table/Spreadsheet)`。
- 选择包含你的节点和边数据的文件。
- 按照导入向导将你的数据映射到Cytoscape的数据模型。
2. 从网络文件导入：
- 选择 `文件(File)` > `导入(Import)...` > `从文件导入网络(Network from File)...`。
- 选择包含你的网络数据的文件格式，如XGMML、SIF或GraphML。
- 加载文件，Cytoscape将自动创建节点和边。
提示
- 你还可以使用 `编辑(Edit)` > `添加(Add)` 菜单以添加具有特定属性的节点和边。
- 要删除节点或边，选择它们并按 `删除(Delete)` 键。
- 要移动节点，使用 `选择(Select)` 工具（箭头图标）将它们拖动到新位置。
在Cytoscape中添加节点和边是构建和自定义网络可视化的基本操作。请记住经常保存你的工作，以避免数据丢失。
