cytoscape如何保存自定义样式

文摘   2024-09-01 09:40   美国  
Cytoscape 是一个图形化网络分析和可视化软件,它允许用户自定义网络中节点和边的样式。保存自定义样式可以通过以下步骤进行:
1. 设置样式:首先,您需要通过 Cytoscape 的样式编辑器来设置节点的颜色、形状、大小,以及边的样式等。
2. 保存样式文件:
   - 在 Cytoscape 软件中,选择 `File` 菜单。
   - 点击 `Export` 选项。
   - 选择 `Styles...`。这将允许您将当前的样式设置保存为一个 `.cy.style` 文件。    
3. 导出样式:
   - 在弹出的对话框中,选择您希望保存样式的地方。
   - 给您的样式文件命名,并确保它具有 `.cy.style` 扩展名。
   - 点击 `Save`。
4. 使用样式:
   - 以后您想要使用这个自定义样式时,可以通过 `File` 菜单下的 `Import` 选项,选择 `Styles...`,然后选择您的 `.cy.style` 文件来应用之前保存的样式。
5. 样式应用:
   - 导入样式后,您可以通过样式管理器(Style Editor)将这个样式应用到网络视图上。
请注意,保存的样式文件只包含样式信息,不包含网络数据本身。因此,您需要分别保存网络和样式。
此外,Cytoscape 还允许通过 Session 文件来保存整个工作环境,包括网络数据、样式和应用了的布局。要保存会话,请按照以下步骤操作:
1. 选择 `File` 菜单。
2. 点击 `Save Session As...`。
3. 在弹出的对话框中,选择保存位置,输入文件名,并确保文件类型选择为 `.cys`。
4. 点击 `Save`。    
通过这种方式,您可以保存当前的所有设置和工作状态,并在将来重新打开时恢复到相同的状态。    

常青树感动心空
全球价值链、环境经济综合核算、ESG、数字化、内观正念相关领域的学习和研讨。
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