2024年，裕策生物与国内外多家医院和科研单位合作，累计发表SCI文章29篇，累计影响因子超过270分。大部分文章是使用空间多组学技术解析肿瘤微环境及其宿主的复杂相互作用，对正常组织和癌变组织的基因组、转录组、蛋白组等数据进行深度挖掘分析。
小编为大家整理了5篇空间多组学文章的研究思路，以供借鉴。
文章标题：Mechanism exploration and model construction for small celltransformation in EGFR-mutant lung adenocarcinomas
合作单位：中国医学科学院肿瘤医院
主要检测平台：RNA-seq、ST、mIF、IHC
研究思路梳理：
Nature Genetics（IF=31.7）｜单细胞测序联合空间多组学揭示非小细胞肺癌新辅助免疫联合化疗的耐药机制
文章标题：Multi-omic profiling highlightsfactors associated withresistance toimmuno-chemotherapyin non-small-celllung cancer
合作单位：同济大学附属上海市肺科医院；同济大学生命科学与技术学院；同济大学医学院；中科院生化细胞所
主要检测平台及入组样本信息：
1）scRNA-seq：19例新辅助ICB联合化疗患者治疗前后26个组织样本，其中治疗后19个样本为手术样本（6个response和13个non-response），治疗前7个穿刺活检样本（3个response和4个non-response）
2）NanoString GeoMx® DSP WTA：新辅助ICB联合化疗患者治疗前的14个样本
3）10x Genomics Visium：新辅助ICB联合化疗患者治疗后的17个样本
研究思路梳理：
Gut (IF=24.5）｜应用单细胞+DSP空间组学揭示胆囊癌免疫生态及Olfactomedin 4机制
文章标题：Comprehensive single-cell analysis decipheredmicroenvironmental dynamics and immune requlatorolfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
合作单位：海军军医大学第三附属医院
主要检测平台及入组样本信息：
1）研究收集了15例胆囊癌（GBC）：1例鳞状细胞癌SCC、2例腺鳞癌混合癌Mixed、12例腺癌AC）、4例胆囊炎（GC）、3例胆囊息肉（GP）、5例胆囊腺瘤（GA）和16例癌旁组织（ANT），进行WGS、scRNA-seq检测和分析；
2） 收集136例GBC患者组织进行IHC检测Olfactomedin 4（OLFM4）表达水平；
3） 收集90例胆囊癌样本的组织芯片进行GeoMx® DSP检测和分析；
4） 通过体外和体内实验进一步验证Olfactomedin 4的分子机制；
检测流程：
Genome Medicine (IF= 10.4) | 空间组学技术助力食管鳞癌发生发展研究
文章标题：Spatial transcriptome profiling identifies DTX3L and BST2 as key biomarkers in esophageal squamous cell carcinoma tumorigenesis
合作单位：苏州大学附属第一医院
样本情况：
24例pT1 ESCC，每例样本均包含4个组织区域：正常组织（N）、低级别异常区（L）、高级别异常区（H）及癌组织（T）
主要研究方法及入组样本信息：
GeoMx DSP空间转录组（11例）
DSP结果验证：IHC（20例）、CosMx SMI单细胞空间转录组（4例）、公共单细胞数据库、功能实验
检测流程：
Journal of Translational Medicine（IF=6.1）｜空间组学显示肺癌气腔播散样本S100P+TFF1+肿瘤细胞与不良预后相关
文章标题：Spatial analyses revealed updatesS100P+TFF1+tumor cells in spread through airspaces samples correlated with undesirabletherapy response in non-small cell lung cancer
合作单位：中国医学科学院肿瘤医院，北京协和医院临床药理研究中心
主要检测平台及入组样本信息：
1）10X visium：FFPE样本 15例患者，其中1例患者存在STAS，14位患者没有存在STAS。
2）多重免疫荧光（mIF）：20例患者，5标6色为panCK、S100P、TFF1、TGFB2、TGFBR2、DAPI
3）免疫组化：70例患者，S100P 和TFF1 检测。
研究思路梳理：
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