文章题目:Emergence
and persistent spread of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniaehigh-risk clones in Greek hospitals, 2013 to 2022
文章链接:doi: 10.2807/1560-7917.ES.2023.28.47.2300571
发表时间:2023.11
发表期刊:Euro Surveill
IF:9.9
研究背景: 肺炎克雷伯菌是医疗保健相关感染的常见原因,由于有效治疗延迟和治疗选择有限,耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌感染与高死亡率相关。迄今为止,欧洲对耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌高风险克隆展开过多次有组织的基因组监测。第一次调查是EuSCAPE调查,该调查于2013和2014年收集了欧洲36个国家的产碳青霉烯酶肠杆菌科的分离株数据。随后的CCRE调查于2019年收集了36个国家的碳青霉烯或黏菌素耐药肠杆菌分离株数据。
研究对象: 310株碳青霉烯-R/I分离株
研究方法:药敏检测(AST)、全基因组测序(WGS)、MLST、cgSNP成对距离、cgSNP系统发育分析
主要研究内容及结果:
1、菌株来源
图1碳青霉烯-R/I肺炎克雷伯菌分离株的core SNP系统发育树(n=310, two ECDC surveys and a national follow-up survey)
图2碳青霉烯-R/I肺炎克雷伯菌分离株的5种最常见ST型的医院分布(n=310, two ECDC surveys and a national follow-up survey)
图3碳青霉烯-R/I肺炎克雷伯菌分离株的5种最常见ST型的时间分布(n=270, the CCRE survey and a national follow-up survey)
图4 碳青霉烯-R/I肺炎克雷伯菌分离株碳青霉烯酶的ST型分布(n=310, two ECDC surveys and a national follow-up survey)
图5利用Pathogenwatch的cgSNP进行“同一医院”/“不同医院”分离对比较
文章结论
1、ST258/512、ST11、ST39、ST147和ST323是希腊调查医院中最常见ST分型。
2、携带blaKPC-2的ST39肺炎克雷伯菌在短时间内传播到全部15家参与研究的希腊医院,可以认为是高风险克隆。ST323具有与ST39类似的传播扩展趋势。
参考文献
Tryfinopoulou K, Linkevicius M, Pappa O, et al. Emergence and persistent spread of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae high-risk clones in Greek hospitals, 2013 to 2022 [J]. Euro Surveill, 2023, 28(47).
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