PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States 2) 是一种基于 16S rRNA 基因序列数据的微生物功能预测工具。相较于传统的测序方法需要大量资源来进行全基因组宏基因组测序，PICRUSt2 利用已知的基因组信息预测微生物群落的功能，从而在节约成本的情况下快速获得功能数据。以下是 PICRUSt2 在微生物功能预测分析中的关键应用和原理解析。
1. 预测微生物群落功能的原理
具体流程如下：
2. PICRUSt2 的优势
高效性：无需宏基因组测序，基于 16S 数据即可实现功能预测，大大降低了时间和成本。
较高的预测准确性：得益于丰富的数据库和优化的算法，PICRUSt2 在准确性和适用性上明显提升。它不仅适用于细菌，还适用于古菌。
灵活性：PICRUSt2 支持多种分析流程和数据库，研究人员可根据需要自定义分析流程，适用于广泛的微生物生态研究。
3. PICRUSt2 结果说明
4. PICRUSt2 在功能预测中的应用场景
a. 人体微生物组研究
b. 环境微生物研究
c. 农业与食品微生物学
5. 限制与注意事项
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