血清型是基于同一物种不同个体间血清抗原的差异来对菌株进行分型的一种方法。与细菌血清型相关的抗原根据其所属的类型,可分为菌体抗原(O抗原)、表面抗原(K抗原)、鞭毛抗原(H抗原)和菌毛抗原(F抗原)4种。其中O抗原又称为脂多糖(LPS)抗原,K抗原又称为荚膜多糖(CPS)抗原。对于肺炎克雷伯菌(K. pneumoniae)而言,主要研究的便是K分型和O分型。
K. pneumoniae的K位点标准化命名法源于鲍曼不动杆菌[1]。K locus type(KL)和K type(K)都被用于描述K. pneumoniae的K抗原分型,简称K分型。其中K type来源于血清学实验,该分型结果较少,最初的血清学分型仅有77种。由于K type不够广泛,许多分离株在血清学上不可分型,为进一步确定K. pneumoniae的荚膜血清型,有研究者提出了用分子分型K locus type来表示K分型的方法。K locus type代表的是荚膜合成位点(K-loci)的多样性,对于早期已鉴定的K type,K locus type参考K type的编号给予相应的编号,而对尚未有血清学表型定义的K locus type,则从101开始分配编号[2],如KL101,KL102等。
图1 K locus/capsule locus/cps locus基本结构
图3 wzi和wzc预测的示例结果
参考文献
[1] Kenyon J J, Hall R M. Variation in the complex carbohydrate biosynthesis loci of Acinetobacter baumannii genomes [J]. PLoS One, 2013, 8(4): e62160.
[2] Wyres Kl, Wick Rr, Gorrie C, et al. Identification of Klebsiella capsule synthesis loci from whole genome data [J]. Microb Genom, 2016, 2(12): e000102.
[3] Brisse S, Passet V, Haugaard A B, et al. wzi Gene sequencing, a rapid method for determination of capsular type for Klebsiella strains [J]. J Clin Microbiol, 2013, 51(12): 4073-8.
[4] Lam M M C, Wick R R, Judd L M, et al. Kaptive 2.0: updated capsule and lipopolysaccharide locus typing for the Klebsiella pneumoniae species complex [J]. Microb Genom, 2022, 8(3).
[5] Wick R R, Heinz E, Holt K E, et al. Kaptive Web: User-Friendly Capsule and Lipopolysaccharide Serotype Prediction for Klebsiella Genomes [J]. J Clin Microbiol, 2018, 56(6).
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