启动子(Promoter)是可被RNA聚合酶识别、结合并起始基因转录的一段DNA序列。由于它与基因的转录密切相关,通常启动子的强度将直接影响基因的转录水平,进而影响整体的基因表达量以及菌株的表型结果。因此启动子在细菌的耐药性和毒力等方面发挥着重要的作用,各种启动子相关的突变,如点突变、片段插入或缺失等都可能会造成菌株耐药性和毒力的减弱或增强[1]。
图2 TE相关的各种启动子模式
图3 A.ST235铜绿假单胞菌分离株的系统发育树;B. CZA耐药菌株的GES-1与外排泵相对表达率;C. 铜绿假单胞菌部分染色体序列的线性分析;D.构建菌株间blaGES-1的相对表达率
[1]Li Y, Wang S. The impact of genetic and environmental regulation on the expression of antibiotic resistance genes in Enterobacteriaceae [J]. Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao, 2021, 37(4): 1092-106.
[2] Lipszyc A, Szuplewska M, Bartosik D. How Do Transposable Elements Activate Expression of Transcriptionally Silent Antibiotic Resistance Genes? [J]. Int J Mol Sci, 2022, 23(15).
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主要内容:
(1)基因的基础特征分析及启动子预测教学;
(2)基因序列转换方法介绍和实操讲解;
(3)蛋白质理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜结构域实操讲解;
(4)蛋白质二级结构、三级结构、结构域在线预测及结果解读;
(5)三维结构演示软件PyMOL的安装和使用教程。
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