1、访问NCBI-BLAST 在线比对网址
访问NCBI-BLAST网址（https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi），并根据查询序列的类型（蛋白或核酸）来选择使用的比对方法
程序名 | 查询序列 | 数据库 | 搜索方法 |
blastn | 核酸 | 核酸 | 库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。 |
blastp | 蛋白质 | 蛋白质 | 库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 |
blastx | 核酸 | 蛋白质 | 先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。 |
tblastn | 蛋白质 | 核酸 | 将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 |
tblastx | 核酸 | 核酸 | 此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列），这样每次比对会产生36种比对阵列。 |
2、在线进行序列比对
2.1 在线进行两序列比对
2.2 在线进行序列与数据库比对
3、比对结果查看
在查看比对结果时，E值以及Score值最重要，E值越小、Score值越大，则比对结果越可靠，点击Graphic summary，会出现图形显示界面，每一条线段代表一个比对结果，鼠标点击会有相应的比对信息。
主要内容：
（1）细菌基因组测序方式：重测序、扫描图、完成图、转录组如何选择？
（2）细茵基因组研究思路和案例分享
（3）常见的比较基因组分析方法有哪些？
（4）什么是水平基因转移（HGT）？如何研究细菌的HGT？
（5）如何通过BLAST软件做比较基因组学分析？
（6）如何绘制比较基因组圈图？
（7）微生物基因组上传NCBI必学要点
（8）微生物进化树结构必学要点
（9）微生物移动元件分析必学要点
链接：https://college.mimazi.net/course/article-39.html
