文章题目：International Epidemiology of Carbapenemase-Producing Escherichia coli
文章链接：doi: 10.1093/cid/ciad288
发表时间：2023.8
发表期刊：Clinical infectious diseases
IF：8.2
抗生素耐药性是一个当前世界上普遍关注的问题，它既对当今患者的治疗提出了挑战，也对全球公共健康构成了日益增长的威胁。耐碳青霉烯类肠杆菌（CRE），如大肠埃希菌（Ec)，因其高水平的抗生素耐药性、当前有限的治疗手段以及通过动态的遗传因子广泛传播的潜力而特别令人担忧。
实验纳入了2017年6月至2018年7月第一次培养出CP-Ec、同时全基因组测序（WGS）发现至少1个碳青霉烯酶基因的患者作为研究对象。随后记录患者的临床数据，包括患者人群特征、临床症状、实验室检查结果、接受的抗菌药物治疗和转归。同时研究者使用临床数据计算2个指数评分（皮特菌血症评分和查尔森共病指数）以捕捉疾病和共病的严重程度。最后研究者们对全部分离株进行了全基因组测序。
研究共有194位患者分离到了CP-Ec，其中来自6个国家的26家医院的114（58%）位患者样本检测到了碳青霉烯酶基因。这些患者的中位年龄为60岁，其中一半为男性。大部分患者是社区获得性感染（(70%; 80/114），在中位数6天时分离陪养到CP-Ec。这些菌株最常见的来源是尿液（34%；39/114）和血液（21%，24/114）。其中43%的分离株（49/114）携带编码有一个MBL基因，另外57%（65/114）不携带MBL基因。分离株的地区分布差异明显（P < .0001)。携带MBL基因的Ec绝大部分来自于中国（23/24），不含MBL基因的分离株则多数来自于美国（21/25）、哥伦比亚（21/26）和新加坡（4/4），黎巴嫩则两种都有。一半的分离株（57/114）伴有符合感染定义的临床症状。相比而言，携带MBL基因的患者不符合感染标准的更多，同时在感染患者中，携带MBL基因的患者比不携带MBL基因的患者在首次陪养阳性时病情更轻。来自血液的分离株中非MBL-Ec占多数，而来自尿液的分离株中MBL-EC更多。
不同国家的ST分型和分子学特征存在一些区域差异，包括碳青霉烯酶（图2A）和广谱β-内酰胺酶（ESBL）基因（图2B）。在MBL-Ec组中，携带blaNDM占大多数(47/49; 96%)，尤其是blaNDM-5 (38/49; 78%)。在非MBL-Ec组中，则携带blaKPC-2最为常见(30/65; 46%)。基因分型和血清型也与是否有MBL状态有关 。高危ST167在MBL中多于非MBL分离株，而ST131在非MBL分离株中更常见。同时在非M BL分离株中H4：025型居多，H9：O101型则在MBL分离株中更常见。在所有CP-Ec中约有52%的分离株携带有获得性的超广谱β内酰胺酶（ESBL），其中大多数是blaCTX-M-15。
图2 对产碳青霉烯酶的大肠埃希菌分子特征的区域差异
表2 产碳青霉烯酶的大肠埃希菌分离株的特性
所有患者在30天内的死亡率为16%（18/114），90天全因死亡率为22%（25/114）；符合感染定义的患者30天死亡率为18%（10/57），在90天时，共有15例患者死亡（26%），均与非MBL-EC分离株相关。携带高风险克隆ST131或ST167的患者中没有死亡病例，而携带ST410的患者中有3例死亡。30天内死亡患者年龄中位数为66岁。在患有菌血症的患者（n=24）中，30天的死亡与MBL状态无关。
