功能基因分析之蛋白质理化性质
学术
科学
2024-10-25 09:28
上海
蛋白质的理化性质是蛋白质所表现的最基础的属性，也是研究分析蛋白首先需要确定的内容。其核心点在于每一种氨基酸的分子量、极性非极性、酸碱性、带电荷情况等存在差异，因此由它们组合而成的蛋白质，其理化性质也会表现出不同的特征。![]()
https://www.bachem.com/knowledge-center/flyers/实验是了解蛋白质理化性质的重要方式，比如SDS-PAGE就经常被用来确定蛋白质的分子量大小。而反过来说，了解蛋白质的理化性质对于我们研究蛋白质也非常有利，它可以成为我们实际研究中的理论支持，指导我们后续的实验和功能分析。比如由于蛋白质是两性电解质，依据等电点pI的特异性，我们可以通过离子交换层析来完成蛋白质的分离纯化。又比如使用紫外-可见分光光度法（UV-vis）来测定溶液的蛋白质浓度时，就可以通过朗伯-比尔定律和蛋白质的消光系数来加以计算。此外，不稳定的蛋白质特别容易发生降解，因此不适合进行长时间的体外实验，那如何确定这个蛋白质是否较为稳定呢，就可以使用理化性质中的不稳定系数来进行判断。Expasy的ProtParam是常用的蛋白质理化性质分析工具，可以预测蛋白质的分子量、等电点、氨基酸组成、原子组成、消光系数、半衰期、不稳定系数、脂肪系数和总平均亲水性。在发表的文章中，针对于单个或多个蛋白的理化性质，我们通常可以把它们整理成表格的形式，比如下面第一副表格展示的便是SARS-COV-2N蛋白的理化性质， 其中包括分子式、氨基酸数目、分子量、理论pI、带正负电荷的氨基酸残基数目、预估半衰期、不稳定系数、脂肪系数、总平均亲水性和亚细胞定位等项目。第二副表格展示的是不同研究样本中26个BpDof转录因子的理化性质，其分析的内容与前一幅图高度相似，体现了所有样本BpDof转录因子的整体情况和不同样本间存在的差异。
![]()
https://doi.org/10.1186/s12866-021-02107-3
![]()
http://doi.org/10.7717/peerj.11938
课程《细菌与真菌功能基因结构特征分析实战》主要针对于细菌、真菌、质粒及部分病毒的功能基因在单基因水平的各类分析做的系列研究。课程包含了各类调控基因、酶基因、跨膜蛋白基因等关键基因的结构分析、理化性质特征分析、启动子区域分析和正反向序列格式转换实操等内容。学习本套课程有助于挖掘特定功能基因发挥生物学作用的内在原因，并为进一步做功能突变、蛋白活性改造等提供靶位点依据。主要内容：
（1）基因的基础特征分析及启动子预测教学；
（2）基因序列转换方法介绍和实操讲解；
（3）蛋白质理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜结构域实操讲解；
（4）蛋白质二级结构、三级结构、结构域在线预测及结果解读；
（5）三维结构演示软件PyMOL的安装和使用教程。
扫描下方二维码或根据链接获取课程
![]()
链接：https://college.mimazi.net/course/article-70.html
【关注我们】
我们专注于微生物组学的测序与个性化数据分析，建有微生物组学研究的科研讨论群，扫码联系客服即可加入微信交流群，随时咨询技术问题。
![]()
