万没想到,院士坐镇的1区也能水?录用率高达75%,要发得赶紧!附一篇浙大团队的范文,代谢组+机器学习,思路简单而有效!

学术   2024-10-19 10:01   上海  
今天筛选到一个“冰火两重天”的期刊,数据看着还可以,但好像又有点小隐患,放出来大家一起来评价看吧。这个期刊就是CNS Neuroscience&Therapeutics
先说一下积极的点:
院士坐镇(由高天明院士担任名誉主编)
国人友好,接受率高(官方给出的录用率仅有20%,,但网友分享的录用比例高达75%,录用难度不高)
年发文数适中(由之前每年100篇左右,去年已涨至443篇)
审稿速度适中(网友经验分享审稿速度约2个月)
有隐患的点:
影响因子波动(由最高的7分,目前已回落至4.8分,与发文量暴涨紧密相关)
降区(虽然仍是中科院医学一区,但已经非TOP了,并且在小类上掉到2区)
版面费(OA期刊,$3,940 USD,约2.8万元,还是比较高的)
综上,作为曾经的中科院1区TOP期刊,出道时质量口碑应该不错的。但是随着近年来显著的扩刊,质量方面可能有些下降,影响因子也有变化。对于更加关注分区的小伙伴来说,4分+的1区可不算太多,需要综合考虑下进行决策了。
那么期刊文章质量到底如何,是否真的好发?小云给大家找了一篇7月份发布的范文,由浙大团队所完成。作者关注于血清代谢学脂质组学与支架内再狭窄(ISR)的相关性。利用机器学习方法识别预后相关代谢物。    
PS:CNS Neuroscience&Therapeutics虽然分数有下降,但毕竟是中科院一区,且投稿难度先对较低,如果单位对分区要求较高,不失为一个好的选择,小伙伴根据自己的需求考虑。同时,组学数据+机器学习,为当前各种生信挖掘的TOP级热点思路!更关键的是,还可以利用公共数据,极大降低研究成本和风险。换种疾病又是一个创新点,小云小小点拨,你是否有更多的思路了呢?如果对此研究设计思路感兴趣,又不知如何下手,欢迎联系小云,思路设计,数据库挖掘,统计分析我统统可以提供全方位帮助哦!

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题目:支架内再狭窄患者代谢组和脂质组的改变
杂志:CNS Neuroscience&Therapeutics
发表时间:2024年7月

研究背景
脑卒中是中国的主要死因,全球第二。颅内动脉粥样硬化性狭窄(ICAS)患病率多变,约3%患者发生支架内再狭窄(ISR),机制不明。代谢物异常与细胞损伤相关,影响脑功能,揭示ISR与非ISR的代谢差异对治疗至关重要。
数据来源
此研究选取浙江大学医学院附属医院神经内科21例短暂性脑出血或缺血性脑卒中后接受支架植入术的患者,周期为2020年9月至2021年12月,具体临床和人口统计学特征见表1。
表1 患者基线特征
研究思路
本研究筛选合格患者,提取血清样本中的代谢物和脂质,通过多反应检测(MRM)模式鉴定并定量脂质。利用超高效液相色谱分离样本,采用R软件进行统计分析,结合多种统计方法分析差异并筛选生物标志物。
研究结果
1.NR和ISR患者血清的非靶向代谢组学分析
研究采集患者的空腹血清样本,进行非靶向代谢组分析,识别出769个代谢物。PCA模型和聚类分析显示样本可分两组。火山分析揭示ISR患者可能存在蛋氨酸代谢障碍。PLS-DA识别出43种关键代谢物,整体通路分析显示ISR患者苯丙氨酸代谢上调,而氨酰基-tRNA生物合成等途径下调显著。
图1 基于非靶向代谢组学的NR和ISR组血清代谢组
2.脂质组学分析区分ISR患者与NR患者
研究通过靶向脂质组学分析了患者的脂质代谢,识别出24类576种脂质。PCA模型基于脂质浓度将样本分为两组,但亚类间无显著差异。与NR患者相比,ISR患者的TAG和DAG脂质减少,火山分析识别出24种显著变化的脂质。脂质本体富集分析显示ISR患者脂质在ER和甘油磷酸胆碱中显著增加,可能关联内皮细胞异常增殖。
图2 基于脂质组学的NR和ISR组血清脂质分析
3.鉴定用于预测 ISR 的潜在血液生物标志物
本研究筛选出16种代谢物和20种脂质,其在ISR与NR患者中水平差异显著。通过分析代谢物和脂质浓度与再狭窄率的相关性,评估了它们作为生物标志物的潜力。逻辑回归和ROC曲线分析验证了模型效能。研究还开发了弹性网络回归模型,准确预测ISR风险。
图3 鉴定用于区分ISR的候选生物标志物
文章小结
本研究首次结合代谢组学和脂质组学分析NR与ISR患者血清,运用机器学习和统计方法预测代谢物,揭示关键代谢途径异常可能是病理进程的重要因素。
PS:CNS Neuroscience&Therapeutics特别适合对文章分区要求较高的小伙伴,如果主题方向合适,可以投稿尝试下。
优秀的课题设计+高质量的数据分析+完美匹配的期刊选择,3者是研究顺利完成的关键!
本文所用到的组学数据+机器学习思路,是发文利器,拿下审稿人还是不在话下的!想复现快来找小云!无论是课题设计,标书评估还是生信分析都可以,朋友们行动起来吧!

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