【课程】微生物测序数据和基因组数据上传NCBI实操

学术   科学   2024-07-31 10:17   上海  




课程简介

本套课程是由上海唯那生物技术团队结合多年的项目分析实战经验,结合着诸多科研客户遇到的各类需求和实践中遇到的各类问题综合开发出来的。课程聚焦于解决实际问题,可操作性强,学习后可以快速高效解决自己的各类上传需求。




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课程内容大纲

 


第一节:微生物基因组上传NCBI必学要点

1细菌、真菌、质粒、病毒等,上传方法有什么异同?

2不同上传方式的区别与差异;

3上传过程中常遇到的问题和解决方案;

4上传流程和材料准备

5经验分享和建议


第二节实操-基因组数据上传NCBI数据库

1基因组数据上传格式要求(细菌扫描图和完成图)

2单个基因组数据上传实操演示

3多个基因组数据批量上传实操演示


第三节:实操-原始数据上传SRA数据库

1原始数据上传格式要求

2原始数据上传实操演示

3提交后的状态查看


第四节:菌种鉴定结果上传到NCBI数据库

1原核生物和真核生物 rRNA提交要求

2)NCBI数据库在线比对方法

3一代测序数据上传实操演示




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