课程简介
本套课程是由上海唯那生物技术团队结合多年的项目分析实战经验,结合着诸多科研客户遇到的各类需求和实践中遇到的各类问题综合开发出来的。课程聚焦于解决实际问题,可操作性强,学习后可以快速高效解决自己的各类上传需求。
课程内容大纲
第一节:微生物基因组上传NCBI必学要点
(1)细菌、真菌、质粒、病毒等,上传方法有什么异同?
(2)不同上传方式的区别与差异;
(3)上传过程中常遇到的问题和解决方案;
(4)上传流程和材料准备
(5)经验分享和建议
第二节:实操-基因组数据上传NCBI数据库
(1)基因组数据上传格式要求(细菌扫描图和完成图)
(2)单个基因组数据上传实操演示
(3)多个基因组数据批量上传实操演示
第三节:实操-原始数据上传SRA数据库
(1)原始数据上传格式要求
(2)原始数据上传实操演示
(3)提交后的状态查看
第四节:菌种鉴定结果上传到NCBI数据库
(1)原核生物和真核生物 rRNA提交要求
(2)NCBI数据库在线比对方法
(3)一代测序数据上传实操演示
【课程】微生物比较基因组精品系列课——全套自学必入的系统课程
课程链接:微生物比较基因组精品系列课【全套】
【课程】微生物比较基因组与群体进化——基因组变异专题研究
课程链接:微生物比较基因组与群体进化
【课程】微生物分子分型-MLST课程——分型全套(含理论、软件、方法)
课程链接:微生物分子分型-MLST课程
【课程】基因组结构分析神器Easyfig实操精品课
【课程】BRIG绘图——结构比较专题2
【课程】密码子偏好性分析——全套(含理论、软件、脚本、方法)
课程链接:遗传密码子偏好性研究课程
【课程】可移动元件研究实战指南——从理论机制到分析实操
课程链接:可移动元件研究实战课程
【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理
课程链接:R语言入门与高通量测序数据实战处理
【课程】肺炎克雷伯菌基因组学研究综合指南
课程链接:肺炎克雷伯菌基因组学研究综合指南
【课程】铜绿假单胞菌基因组研究综合分析实战
课程链接:铜绿假单胞菌基因组研究综合分析实战
【课程】微生物基因组生信必学课程
课程链接:微生物基因组生信分析必学课程
【课程】微生物生防菌研究
课程链接:生防菌的系统化研究
【资料】耐药专题材料
【资料】生防专题材料
扫码添加唯那生物技术客服小唯的微信二维码,备注“耐药专题”或“生防专题”,立马获取
客服小唯二维码
如有相关课程问题,请添加“客服小唯二维码”咨询
1、生信技能课专辑
2、耐药毒力专题
3、肺炎克雷伯菌专题
4、密码子偏好性专题
7、软件脚本分享
9、知识干货
10、分泌系统
11、软件下载
12、书籍下载
【关注我们】
我们专注于微生物组学的测序与个性化数据分析,建有微生物组学研究的科研讨论群,
微信公众号【密码子实验室】分享各类技术贴。