小分子抑制剂可以通过不同的机制激活潜伏的HIV，使其表达HIV病毒蛋白，从而可以被宿主的免疫系统识别并清除，这对于开发清除HIV病毒储存库的新疗法至关重要。
| 组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）机制
ART药物如伏立诺他（SAHA）、罗米地辛（RMD）和帕比司他（PNB）通过抑制HDAC的活性，增加组蛋白的乙酰化水平，从而使染色质结构松弛，解除潜伏HIV病毒基因组的沉默状态，激活基因的转录和HIV病毒基因组的表达。
| 蛋白酶C（PKC）激动剂机制
通过激活PKC信号通路引起核因子κb和激活蛋白1活化，从而激活潜伏HIV-1。小分子PKC激动剂，例如苔藓抑素（bryostatin）和炔诺醇B（Ingenol B），具有HIV病毒库潜伏激活的作用。
| TLR7激动剂机制
如GS-9620，能够激活猴子体内的CD4+T淋巴细胞和NK细胞，同时还能激活潜伏的HIV病毒。
| SMAC模拟物机制
某些SMAC模拟物能够激活潜伏的HIV-1，通过影响细胞凋亡途径来重新激活病毒。
| DNA甲基化机制的干扰机制
HIV-1的持久性机制之一是DNA甲基化，细胞蛋白UHRF1参与维持HIV-1潜伏期，特别是通过将DNA甲基化机制招募到病毒基因组中。UHRF1的抑制会引起HIV-1在细胞储库中的再激活。
| 免疫调节剂机制
增强免疫系统对感染HIV细胞的识别和杀伤，如Romidepsin（一种HDAC抑制剂）：研究显示对CD8+ T细胞功能的改善，增强免疫应答。
