爱基百客搭载华大智造MGISP-960&AlphaTool,实现建库流程自动化

学术   2025-01-09 13:59   湖北  

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随着测序技术的不断发展,高通量测序技术已经成为基因组、转录组、表观等领域的重要研究工具。该技术全流程操作较为繁琐,为了提高湿实验环节的效率,准确性和稳定性,众多实验室已引入自动化核酸提取仪和高通量自动化建库仪,解决了手工操作一大难题。然而在看似简单的文库均一化和Pooling环节,因每个样本移液体积不同和移液逻辑不规律,一度成为实验人员最头疼的步骤。
为此,爱基百客携手华大智造,基于华大智造MGISP-960高通量自动化样本制备系统进行建库后,利用华大智造AlphaTool移液机器人完成均一化/Pooling实验,助力爱基百客基因组学和转录组学自动化建库
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测评方案

01测试应用场景
基因组/转录组文库构建。


02测评方案以及结果判断标准
A
测评方案:基于MGISP-960分别对96例DNA/RNA进行自动化建库,手动定量。接下来,利用AlphaTool分别对96例文库进行均一化和Pooling,后上机测序以及分析。
B

评判标准:计算实际测序数据量和理论测序数据量偏差,CV≤15%为合格。


03MGISP-960测评配置方案
A

MGISP-960配置方案:

MGISP-960高通量自动化样本制备系统进行建库

B

MGISP-960配置2基因组DNA建库台面布局:96样本/run


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C

MGISP-960配置2转录组RNA建库台面布局:96样本/run


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04AlphaTool测评配置方案
A

AlphaTool配置方案:

从左到右:单通道移液头(1-1000 μl)、8通道移液头(1-200 μl)、1.5ml离心管适配器
B

AlphaTool文库均一化&Pooling台面布局:

文库均一化台面
  • 样本通量:96例样本/Run
  • 样本放置区:POS7(96孔PCR板)
  • 稀释液放置区:POS4(96孔深孔板)
  • 均一化产物放置区:POS8(96孔PCR板)
  • 200 μl吸头放置区:POS1和POS2

文库Pooling台面

  • 样本通量:96例样本/Run
  • 样本放置区:POS8(96孔PCR板)
  • Pooling产物放置区:POS12(搭配1.5ml离心管适配器)
  • 50 μl吸头放置区:POS1


05实验流程


06测试结果
  • 分别针对96例DNA/RNA,利用 MGISP-960 进行自动化建库,文库产出平均值为60 ng/ul,符合建库要求
  • 针对192例文库利用AlphaTool进行均一化和Pooling,实际测序数据量与理论测序数据量平均偏差在11.6%,符合标准;另测序结果显示Mapping Rate为98.6%、GC含量为49.3%,Q20为99.2%、Q30为97.4%,各性能指标表现优异。


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本期建库流程的测评,展示了自动化技术在提高实验效率、数据稳定性和重复性方面的显著优势。这些设备不仅大幅减少了人工操作带来的误差,还大大缩短了实验周期,为高通量测序项目的快速推进提供了强有力的保障。同时,这也标志着我们公司在科研服务领域的硬件实力又迈上了一个新的台阶。目前,爱基自动化设备已全面覆盖提取、建库及文库均一化流程。未来,我们将持续引入并优化更多先进设备,结合深厚的技术经验,为客户提供更加全面、高效和高质量的科研服务解决方案,助力生命科学研究的持续发展。
关于爱基百客

武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客)是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。公司办公面积逾3000m2,员工已达到百余人,业务覆盖全国,核心团队来自国内知名高校和基因测序公司。公司先后引入ChIP、ATAC-seq、CUT&Tag、单细胞(进口、国产多平台)、DNBSEQ-T7和STOmics时空组学等实验平台,同时配备MGISP-960和AlphaTool等自动化设备。

运营至今合作科研客户超2000家,涵盖国内知名科研院所、高校及相关企业。多项合作成果发表在Science、Cancer Cell、Circulation、Nature CommunicationsPlant Cell等国际顶级期刊,广受客户好评,成为国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。爱基百客将秉承服务至上的理念,发挥自身优势,期待与海内外科研学者精诚合作,共探生命百科全书。



关于华大智造

深圳华大智造科技股份有限公司(简称华大智造)秉承“创新智造引领生命科技”的理念,致力于成为生命科技核心工具缔造者,专注于生命科学与生物技术领域,以仪器设备、试剂耗材等相关产品的研发、生产和销售为主要业务,为精准医疗、精准农业和精准健康等行业提供实时、全景、全生命周期的生命数字化设备和系统。

华大智造成立于2016年,截至2024年6月30日,华大智造员工总数超过2,670人,研发人员占比约32.16%,业务布局遍布六大洲100多个国家和地区,在全球已建立9大研发中心、7 大生产基地、9大国际仓库,以及超10 个客户体验中心,服务累计超过3,000个用户,已成为当前全球少数几家能够自主研发并量产从 Gb级至 Tb 级低中高不同通量的临床级基因测序仪企业之一。



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爱基百客是一家专业提供表观组学、单细胞与空间组学以及高通量测序分析的新型生物科技服务企业,旗下拥有DNBSEQ-T7、10xGenomics等平台,依托表观技术的优势,为生命科学研究和医疗健康等领域提供方案设计到数据分析一站式服务。
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