转录因子是一类能够调节基因表达的蛋白质,广泛参与植物的生长发育、环境适应和防御反应。通过与DNA特定序列结合,转录因子可以启动或抑制目标基因的表达。它们对于植物合成代谢、形态建成以及应对环境压力,如干旱、盐碱和病虫害等,至关重要。研究植物转录因子有助于理解植物的生命过程,并通过基因工程改良作物,提高其产量和抗性,推动现代农业的发展。
过去,筛选转录因子下游靶基因主要依赖于ChIP-seq,但在植物转录因子的应用中存在一些痛点——缺乏特异性抗体;表达标签蛋白的转基因植株制备周期长、失败率高且成本高;所需样本起始量大,某些植物难以满足;某些作物的经济器官具有坚硬的细胞壁和复杂的代谢物,实验失败概率较高。
DNA亲和纯化测序(DAP-seq)结合了蛋白质体外表达技术与高通量测序,通过孵育体外表达的转录因子(TF)蛋白与裸露的全基因组DNA片段,以确定结合序列。自问世以来,该技术已广泛应用于转录调控和表观组学研究。其最大优势在于不受抗体和物种限制,特别适用于难以获取抗体的样本(如植物)。
武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,是一家专业提供表观组学科研服务、单细胞与空间组学测序分析和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。公司先后引入ChIP、WGBS、ATAC-seq、DNBSEQ-T7、10x Genomics、SeekOne® DD、DNBelabC-TaiM4和Stereo-seq等实验平台,不断提升公司的科研服务能力。
· 往期直播回顾 ·
精选合集,欢迎收藏哟!