爱基百客云平台小工具使用
1.1 爱基百客云平台小工具科研常用绘图之火山图
1.2 参数设置
1.3 任务查看
1.4 结果
1.4.1 火山图
1.4.2 差异表格
首先，打开爱基百客官网：http://www.igenebook.com；点击菜单栏最右侧“云平台”按钮。
登陆后，如下图，我们进入到小工具专栏。当前云平台已上线了32款小工具供大家使用，包括基础绘图，高级绘图，差异检验，聚类分析，序列处理等子模块，本着用户至上的理念，平台小工具将会持续更新维护，积极接受用户的反馈和意见。
火山图（Volcano Plot）是一种常用的统计图表，其本质是基于差异倍数和显著性的二维散点图。因其形状像喷发的火山，故名火山图。广泛应用于生物信息学和基因组学研究中。它主要用于展示成千上万个基因或蛋白质的差异表达分析结果，帮助研究人员快速识别显著变化的特征。
火山图能够同时显示 fold change 和 显著性 两个重要指标，提供全面的信息。另外可以根据不同的研究需求调整阈值，以适应不同的分析场景和需求。
爱基百客云平台火山图可视化地址：http://182.61.3.169:5000/smalltools/detail?id=1702499619562348545。
下面我们进行火山图可视化实操练习。
首先点击小工具火山图。
右侧的工具介绍对火山图小工具的主要用途，使用方法以及结果解读做了详细的说明。左侧是必要的输入文件和参数选项。任务名称和任务编号系统会自动生成。后面可用于记录查看具体的任务。小工具提供了示例文件给用户做测试分析。同时，该页面还提供了一些常用参数调节选项。您也可进行自定义，后面将详细介绍。输出名自定义，默认result。
输入文件：支持txt(制表符分隔)文本文件，以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。
输入文件之间需用制表符(Tab键)分隔，第一行为表头信息，第一列为gene或蛋白名，其余列必需包含差异的logFC列和显著性列。如下表所示：
您可在任务管理栏中查看任务的运行情况和结果。默认情况下新任务将会在最上方展示，也可通过任务名、任务编码、日期点击查询，找到需要的任务。
如下图：当状态成功时，表示任务成功结束。
点击下载按钮可直接打包下载全部结果。点击查看按钮可在线查看结果。
您可在在线查看结果后选择是否下载保存。另外如果结果较多时，结果展示区还可通过点击左侧或右侧的箭头进行图片切换。您可挑选自己感兴趣的结果图片进行下载保存。
输出结果包含pdf格式和png格式的火山图以及图对应的差异表格。
1.4.1 火山图
也可根据自己的喜好换个配色试试。通过改变上调基因以及下调基因颜色即可实现。
1.4.2 差异表格
差异表格如下表所示：
精选合集，欢迎收藏哟！
