转录因子是具有DNA结合域的蛋白质，它与启动子和/或增强子区域的特定DNA序列结合，并与其他辅助因子和RNA聚合酶II相互作用，调控靶基因的转录。
基因调控及其关键元件。转录因子（TFs）与启动子区域和顺式调节元件（CREs）结合，取代核小体，使转录起始位点可接近。TFs、辅助因子和其他蛋白质之间的合作允许RNA聚合酶蛋白复合物的招募和稳定，DNA合成mRNA[1]。
往期，我们分享了不少关于转录因子的推文，从介绍，研究方法到研究思路。
转录因子研究策略大体分为四个方面，从筛选，到验证，功能分析，再到下游的机制研究。与之对应的技术手段如下。
往期，我们聊到频率比较高的是研究技术和思路，今天我们重点关注下肿瘤相关的转录因子。
肿瘤研究是国内外科学界的一个重要热点领域，国家自然科学基金每年资助的肿瘤相关项目也相对较多。转录因子被认为是极具潜力的治疗靶点的一个主要原因是转录失调在多种疾病中发挥着重要作用，而肿瘤研究中有一些研究频率较高的明星转录因子。
癌症被定义为细胞的不受控制的增殖，主要是由于原癌基因和/或肿瘤抑制基因的调控失调。因此，原癌基因可能因突变、染色体易位、基因扩增和表观遗传变化而成为激活的“功能获得”癌基因。类似地，负责细胞周期负调控的肿瘤抑制基因，可能由于“功能丧失”突变或其中一个等位基因的缺失而失活。
癌基因可以被分类为细胞内信号转导因子、细胞周期调节因子、生长因子或生长因子受体、凋亡抑制因子以及转录因子（TFs）。据估计，约有20%的致癌基因被鉴定为TFs，而其中有一些明星转录因子是研究的较多的。如p53、Myc、雄激素受体 (AR)、雌激素受体 (ER) 、缺氧诱导因子 (HIF)、NF-κB等转录因子，它们参与各种促癌事件[2]。p53是研究最多的肿瘤抑制因子，在超过50%的人类癌症中发生功能获得性突变失活或变成致癌物。核受体AR和ER分别与内分泌驱动的前列腺癌和女性癌症（如乳腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌）的发病机制密切相关。HIF-1在大多数实体瘤中过度表达。NF-κB是经典激活巨噬细胞的关键转录因子，可介导产生大量炎症因子。
我们汇总研究频率较高的癌症转录因子。
除了表上统计的，其实还有很多其他的明星转录因子。比如说FOX家族蛋白，它是一个转录因子大家族，它共享一个高度保守的100个氨基酸的DNA结合结构域（DBD），称为叉头结构域。这些转录因子参与调控许多生物过程中关键基因的表达，包括发育、代谢、分化和免疫反应。
Fox转录因子家族被分为若干亚家族，每个亚家族以一个字母标识（例如，FoxA、FoxB、FoxC等）。它是现今肿瘤学、医学细胞生物学、遗传学、免疫学等领域的研究热点。其多个家族成员可作为肿瘤靶向治疗直接或间接的作用靶点，在一些肿瘤类型中，也可作为肿瘤早期诊断或预后监测。在肿瘤研究中，FOX（Forkhead Box）转录因子家族涉及多个成员，除了FOXO类和FOXK类蛋白，还有其他一些FOX转录因子（FOXM1、FOXP3、FOXA 类 (FOXA1, FOXA2, FOXA3)等）也受到研究者的关注。
类似地，STAT蛋白家族也是一组重要的转录因子，在细胞信号传导和基因调控过程中发挥关键作用。STAT蛋白通过JAK-STAT信号通路被细胞因子和生长因子激活。激活后的STAT蛋白可转移到细胞核，调控与细胞生长、分化、凋亡以及免疫反应相关的基因表达。STAT蛋白家族由七个主要成员组成：STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5A、STAT5B和STAT6。
研究单位：中国科学院动物研究所
发表期刊：Cancer Cell
研究技术：ChIP-seq,RNA-seq等
组织类型：CAR-T细胞 主要内容：CAR-T细胞疗法在治疗血液癌症中显示出显著的疗效，但在治疗实体瘤方面的疗效有限，主要挑战之一是T细胞衰竭。为了解决这一挑战，研究者建立了一个体外CAR-T细胞功能低下模型，并筛选候选基因，发现敲除BATF可以提高CAR-T细胞的抗肿瘤性能。研究对象BATF转录因子是AP-1家族蛋白，其对T细胞发育和功能很重要的。 功能发现：BATF通过结合和调节CAR-T细胞中的相关基因，驱动T细胞衰竭并抑制中央记忆亚群的形成。BATF的消耗增强了CAR-T细胞对实体肿瘤的抗肿瘤活性。
· 转录因子YB-1正调控KLF5，促进基底样乳腺癌的进程
· YB-1 is a positive regulator of KLF5 transcription factor in basal-like breast cancer.
研究单位：中国科学院昆明动物学研究所
发表期刊：Cell Death & Differentiation.
研究技术：ChIP-seq,RNA-seq等
组织类型：人类乳腺癌细胞系 主要内容：BLBC是一种预后较差的乳腺癌亚型，与雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和HER2三阴性乳腺癌亚型有很大重叠。该研究主要关注KLF5和YB-1两个转录因子，它们都是已知的癌基因。研究揭示了YB-1在BLBC中的多重调控机制，特别是其对KLF5的正调控作用。YB-1不仅通过转录激活促进KLF5表达，还通过稳定m5C修饰的KLF5 mRNA发挥作用。
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