转录因子是一类能够调节基因表达的蛋白质，广泛参与植物的生长发育、环境适应和防御反应。通过与DNA特定序列结合，转录因子可以启动或抑制目标基因的表达。它们对于植物合成代谢、形态建成以及应对环境压力，如干旱、盐碱和病虫害等，至关重要。研究植物转录因子有助于理解植物的生命过程，并通过基因工程改良作物，提高其产量和抗性，推动现代农业的发展。
过去，筛选转录因子下游靶基因主要依赖于ChIP-seq，但在植物转录因子的应用中存在一些痛点——缺乏特异性抗体；表达标签蛋白的转基因植株制备周期长、失败率高且成本高；所需样本起始量大，某些植物难以满足；某些作物的经济器官具有坚硬的细胞壁和复杂的代谢物，实验失败概率较高。
DNA亲和纯化测序（DAP-seq）结合了蛋白质体外表达技术与高通量测序，通过孵育体外表达的转录因子（TF）蛋白与裸露的全基因组DNA片段，以确定结合序列。自问世以来，该技术已广泛应用于转录调控和表观组学研究。其最大优势在于不受抗体和物种限制，特别适用于难以获取抗体的样本（如植物）。
以下直播回顾将为您解析DAP-seq的技术，如何利用DAP-seq进行植物转录因子的研究？以及“蛋白DNA互作三大技术DAP-seq、ChIP-seq和CUT&Tag有什么差异？DAP-seq实验流程是什么样?如何进行DAP-seq的数据挖掘？”
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1. 转录因子简介
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