自2009年首次报道以来,单细胞取得了显著进展,并广泛应用于多个科研领域,如组织异质性研究、新细胞类型的鉴定、肿瘤微环境研究、发育生物学和植物学等。虽然早期的单细胞研究主要集中在单细胞转录组,但随着技术的进步,单细胞表观组(如scATAC-seq)也逐渐受到关注。单细胞多组学通过同时分析单细胞水平上的多种组学信息(如基因组、转录组、表观组、蛋白质组、代谢组),提供了研究细胞异质性和复杂基因调控机制的全面视角。因此,单细胞多组学成为越来越多研究的新选择,其中“单细胞RNA-seq+单细胞ATAC-seq”和“单细胞转录组+空间转录组”是较为热门和实用的组合。
单细胞RNA-seq与单细胞ATAC-seq结合可以捕获细胞内mRNA表达和评估基因组区域的染色质可及性,帮助识别调控元件和转录因子对基因表达的影响,揭示复杂的基因调控机制。通过比较不同状态下的RNA和ATAC-seq数据,可以探索细胞在发育、分化和应答中的变化,如从干细胞到特定分化细胞类型的过渡。
单细胞转录组与空间转录组结合可以分析细胞特性与空间分布的关系,揭示组织内细胞相互作用及其功能。这种组合还帮助识别肿瘤微环境、免疫细胞分布和其他生物组织的异质性,提供新的生物标志物和潜在治疗靶点。
“单细胞RNA-seq+单细胞ATAC-seq”和“单细胞转录组+空间转录组”如何联合?本周三(11月13日)晚上19:00 ,在爱基百客视频号直播间准点开始“单细胞多组学联合分析思路”直播课程,由我们的技术支持武文豪和大家分享单细胞多组学的研究切入点和思路。欢迎大家来直播间和我们交流~
武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,是一家专业提供表观组学科研服务、单细胞与空间组学测序分析和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。公司先后引入ChIP、WGBS、ATAC-seq、DNBSEQ-T7、10x Genomics、SeekOne® DD、DNBelabC-TaiM4和Stereo-seq等实验平台,不断提升公司的科研服务能力。
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