流式抗体缺货,染料性能缺陷,怎么办?

文摘   2024-11-28 12:11   湖北  

OMIP-069 version 2报告了对原始40c全光谱流式细胞术方案的更新,解决了试剂可用性和性能进一步优化问题,通过替换部分试剂,成功保留并提升了对人类外周血主要细胞亚群进行深入免疫表型分析的能力。

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变更内容

  1. CD20 Pacific Orange™

    变更原因:经常缺货

    变更后的试剂:CD20 Spark Violet™ 538 (Biolegend Cat. 302373)。

    变更后的表现:成功替换了原始试剂,保留了方案的性能。

  2. CD25 PE-Alexa Fluor™ 700

    变更原因:经常缺货

    变更后的试剂:CD25 cFluor® BYG710 (Cytek Biosciences Cat. R7-20660)。

    变更后的表现:提供了与原始试剂相似的分辨率和模式。

  3. CD24 PE-Alexa Fluor™ 610

    变更原因:经常缺货

    变更后的试剂:CD24 cFluor® YG610 ( Cytek Biosciences Cat. R7-20658 )。

    变更后的表现:提供了与原始试剂相似的分辨率,减少了对蓝激光激发的荧光染料的扩散。

  4. CD127 APC-R700

    变更原因:经常缺货

    变更后的试剂:CD127 cFluor® R720 (Cytek Biosciences Cat. R7-20664 )。

    变更后的表现:提供了与原始试剂相似的分辨率。

  5. HLA-DR PE/Fire™ 810

    变更原因:技术问题,光照下可能易发生串联降解

    变更后的试剂:HLA-DR BV480 (BD Biosciences Cat. 752499)。

    变更后的表现:提供了稳定的性能,减少了数据中的错误。

  6. TCRγδ PerCP-eFluor® 710

    变更原因:技术问题,由于意外的光谱特征

    变更后的试剂:TCRγδ PerCP-Vio® 700 (Miltenyi Cat. 130–113-514)。

    变更后的表现:尽管染色模式有所变化,但阳性事件的频率保持不变。

  7. IgD BV480

    变更原因:需要更好的性能

    变更后的试剂:IgD cFluor® BYG750 (Cytek Biosciences Cat. R7-20662)。

    变更后的表现:提供了与原始试剂相似的分辨率,增加了亮度。

  8. CD57 FITC

    变更原因:FITC 和 BB515之间的相似性指数高(0.98),导致数据中的高扩散

    变更后的试剂:CD57 cFluor B532(Cytek Biosciences Cat. R7-20656)。

    变更后的表现:显著降低了与BB515之间的相似性指数和溢出扩散值,改善了数据质量。

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变更原因和变更后表现

图1. 试剂稳定性、特异性和可用性面临挑战:(A)PE/Fire 810试剂在光照下稳定性差,导致解混错误;(B)TCRγδ PerCP-eFluor 710染色人全血出现意外的光谱特征;(C)TCRγδ分辨率低,调整染色条件未能改善;(D)FITC与BB515高度相似,导致多个通道数据扩散高,移除FITC可减少扩散。

图2. 变更前后比较:通过外周血单个核细胞上的染色指数比较了染色模式和分辨率,具有相似的阳性细胞百分比。

图3. 变更试剂的性能评估:包括不同染料标记CD57的滴定比较,以及CD57 cFluor B532在多色方案中不同CD8 T细胞亚群上的表现。同时,对CD24的抗体性能进行了滴定。结果显示,变更后试剂能有效识别目标细胞群体。

图5. 在多色染色中,变更后的荧光染料提高了细胞群体的分辨率,这得益于荧光染料亮度的提升(CD57 cFluor B532、CD20 Spark Violet 538、IgD cFluor BYG750、HLA-DR BV480、CD25 cFluor BYG710和CD127 cFluor R720)和/或背景的减少(CD57 cFluor B532、TCR γδ PerCP-Vio700、IgD BYG750、CD24 cFluor YG610、CD127 cFluor R720)。

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变更后方案内容

变更试剂以粗体突出显示,试剂按字母数字顺序排列。

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方案整体表现

图4. 方案变更前后表现:在执行UMAP分析后,运行FlowSOM对数据进行聚类。变更后,所有细胞亚群的分辨率得以保留,并且在某些情况下有所提高。

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重要提示

  1. 在无法判断表现情况时,同克隆的PE试剂表现是个很好的参考标准(如CD57 cFluor B532和CD57 FITC在CD8+T各亚群上的Pattern不一致时)。

  2. 人全血样本使用TCRγδ PerCP-eFluor 710染色后出现异常光谱特征,不同于自发荧光,导致细胞群体分辨率降低。尽管采取了多种措施,包括滴定和添加阻断剂,问题仍不能得到改善。

  3. TCRγδ不同克隆(B1.1与REA591,均为所有循环TCRγδ的泛标志物)染色模式有所变化(使用B1.1克隆时观察到三个对角线群,而使用REA591克隆时仅观察到一个单一对角线群),但阳性事件的频率保持不变,推测这两个克隆结合到不同的构象表位,导致染色轮廓的差异。通过CD3+ TCRγδ+群体内TIGIT、CD38、CD27和CD45RA的表达,证实了两个克隆均能有效识别delta变体Vd1和Vd2。

总结


流式多色方案没有最好,只有更好,随着时间的推移,以及新染料新试剂的开发,对已发表OMIPs和其他多色方案根据实际需要进行优化是必要的。

Reference

OMIP-069 version 2: Update to the 40-color full Spectrum flow cytometry panel for deep immunophenotyping of major cell subsets in human peripheral blood

https://doi.org/10.1002/cyto.a.24898

流式通




















陈在不在
作者自媒体 @ 生命科学与大健康产业 —— 聚焦原创,相信正向,眼中有光,一路向阳
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