BioRxiv|CUT&Tag一种高效高分辨率的植物表观基因组学研究方法,让ChIP-seq汗颜!

文摘   2024-10-25 06:31   法国  


前言

表观基因组学研究通过分析不同组蛋白翻译后修饰定义的染色质状态,对于理解动物和植物系统中基因表达的表观遗传调控至关重要。


CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation) 是一种新型的酶锚定表观基因组分析方法,最初开发用于哺乳动物细胞。


本文作者对约 0.01 克拟南芥幼苗中的三种组蛋白修饰 H3K27me3、H3K4me3 和 H3K27Ac 的全基因组分布进行了分析。通过比较 ChIP-seq 和 CUT&Tag 生成的 H3K27me3 谱,作者发现两种方法捕获了相同的表观基因组广谱信息,以及特异的峰值。

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