BioRxiv|基于 Ribo-BiFC 的植物体内翻译状态可视化方法

文摘   2024-09-27 06:48   法国  


前言

翻译是每一种生物体的基本过程。在植物中,翻译速率在发育过程中以及响应环境线索而受到严格调节。


然而,很难在体内测量组织的实际翻译状态。


在这里,Raabe et al 报告了一种基于双分子荧光互补的体内翻译标记 Ribo-BiFC。


作者将最初为果蝇开发的方法与先前在植物中描述的改进的低背景分裂 mVenus BiFC 系统相结合。我们用 mVenus 荧光蛋白的片段标记了拟南芥小亚基核糖体蛋白(RPS)和大亚基核糖体蛋白(RPL)。在 80S 核糖体组装后,mVenus 片段互补并通过荧光显微镜检测。

作者表明,这些重组蛋白在烟草表皮细胞中非常接近,尽管与已知相互作用物的 BiFC 信号相比,信号有所降低。这种 Ribo-BiFC 方法系统可用于稳定转基因品系,以实现植物组织中翻译速率的可视化,并可用于研究翻译动力学及其在植物发育、非生物胁迫或不同遗传背景下的变化。

当然,BiFC的方法容易操作,很多实验室都可以做,但还是很有局限的:80S核糖体的组装能不能真实的反应翻译效率?当然不能,只能反应翻译效率的一个侧面。BiFC看到的80S核糖体可能是碰撞,阻滞不前,或者在翻译其他的开放阅读框,这几种情况都是翻译效率低下的表现,80S的组装比较能说明的是翻译起始没有受到阻碍。

想知道一条mRNA或者整体的翻译水平,还是需要结合 Ribosome profiling,报告基因,或者 35S-Met/AHA标记 等方法。

本文的一个严重缺陷就是没有系统的通过化学抑制剂以及其他已知的重要翻译调控元件来研究BiFC的动态性和可靠性。希望对蛋白翻译效率感兴趣的实验室能够尽快以此为基础建立一个优化的系统。


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