人脑发育是经过一系列由转录因子表达和染色质可及性变化所诱导的、紧密组织的模式化事件来实现的。2024年5月1日,瑞士卡罗林斯卡医学院领导的一个国际研究团队在《自然》杂志上展示了怀孕后第一孕期(6-13周)整个发育过程中人类大脑的染色质可及性和配对性基因表达图谱。研究人员定义了135个簇,并使用多组学测量将候选顺式调控元件与基因表达联系起来。利用卷积神经网络,鉴定了增强子中可能的功能转录因子结合位点,这些位点特征化了神经元亚型。并将这个模型应用于与ESRRB(一种转录因子)相关的顺式调控元件,以阐明其在浦肯野细胞谱系中的激活机制。通过将疾病相关的单核苷酸多态性与顺式调控元件联系起来,研究人员还在几种疾病中验证了可能的病理机制,并确定中脑衍生的GABA能神经元对重度抑郁症相关突变量最为敏感。该图谱可用于发现儿童脑发育过程中出现的问题,从而有利于寻求适合的治疗方法。
编译整理|郑颖
本期编辑|刘怡伶
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