另外, 应用抗菌药物后可影响细菌培养结果。因此，在采集呼吸道标本进行细菌培养时尽可能在抗菌药物应用前采集，避免污染，及时送检，其结果才能起到指导治疗的作用。目前常用的方法有：
1. 痰：采集方便，是最常用的下呼吸道病原学标本。采集后在室温下 2 小时内送检。先直接涂片, 光镜下观察细胞数量，如每低倍视野鳞状上皮细胞 < 10 个, 白细胞 ＞ 25 个，或鳞状上皮细胞：白细胞 < 1：2.5，可作为污染相对较少的「合格」标本接种培养。痰定量培养分离的致病菌或条件致病菌浓度 ≥ 107 cfu/mL，可以认为是肺部感染的致病菌；≤ 104 cfu/mL 则为污染菌；介于两者之间建议重复痰培养；如连续分离到相同细菌，105~106 cfu/mL 连续两次以上, 也可认为是致病菌。
