WXRedian | 生信钱同学

公众号生信钱同学

周期

共找到 15 条记录

原来病理组学的质控是这么做的，这篇NC解决了这个问题

文摘 2024-12-18 10:31 北京

为方便大家学习和资料管理，后续资料将通过另一个平台进行发放和汇总GrandQC：数字病理领域质控问题的全面解决方案随着病理学数字化的推进，GrandQC工具的诞生标志着质量 ...

刚发的NC,想把空间组学学透，那就看这篇。一个技术不够，就多用几个

文摘 2024-12-17 07:04 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效，代码在文末近日，一项关于肺腺癌的前沿研究为我们揭示了肿瘤发展过程中的重要信息。由日本多位研究机构联合开展的研究，通 ...

NCBI公共数据库中的数据该怎么下载，一条命令自动并行下载，公共数据深度挖掘

文摘 2024-12-16 07:00 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,下载数据的工具我已经帮大家下好了，在文末之前跟大家介绍了，我们开启了数据分析项目，目前主要针对上游分析（没有服务器 ...

Nat Genet｜还是经典的课题设计，这些生信思路适用于临床科研人员——空间组学数据分析

文摘 2024-12-14 10:22 北京

类似的课题也比较多，都是关注药物或者其他方式干预后单细胞或组织微环境的变化，这种数据价值比较真贵，毕竟要追踪一个病人的治疗前后，还要拿到组织这篇文章用到的单细胞数据对空间数 ...

Spateo-空间转录组的瑞士军刀-教程3：重构3D组织——切片对齐：基础使用

文摘 2024-12-13 07:00 北京

之前关于Spateo的介绍已经分享两期了Spateo-空间转录组的瑞士军刀-教程1：细胞分割Spateo-空间转录组分析流程2：空间可变基因空间转录组通过对组织切片进行 m ...

实用型绘图技巧分享——如何让热图的列聚类按照自己的想的顺序展示呢

文摘 2024-12-12 09:43 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,代码在文末很多小伙伴反应不会绘图，其实我之前分享的那些源代码绘图都挺好的，但确实需要一些门槛，猛的一看会有一些看不 ...

又看到这个单细胞差异丰度分析用在顶刊上了，可以试下

文摘 2024-12-11 07:02 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,代码在文末https://github.com/GiuseppeTestaLab/organoidMultiple ...

单细胞多组学，空间数据分析代码，这篇Nature Medicine可以学

文摘 2024-12-09 07:02 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,代码在文末揭示人类胚胎早期发育的关键密码：研究解读胎盘的多维空间多组学全景图近日发表在《自然医学》（Nature ...

这篇Nature生信和实验部分衔接的太好了，简单的机制和思路。生信找东西，有用

文摘 2024-12-08 07:00 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,这篇文章重在思路这篇文献思路非常好，明确，清晰，也不会设计多深的机制，弄的眼花缭乱的。简直就是从组学到实验的完美融 ...

从Nat Cancer 详解Scenic+用法：单细胞转录因子分析

文摘 2024-12-06 07:04 北京

昨天的推送原来Scenic转录因子分析升级到Scenic+了，这篇Nat Cancer做了一个示范应用中，钱博士和大家推送介绍了SCENIC+的文献应用。钱博士前几天和我聊 ...

Nature genetics你的单细胞数据也可以分析可变剪接，快补上这个分析

文摘 2024-12-05 07:01 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,代码地址在文末除了分析这篇文章之外，我还检索到了一位非常优秀的学生笔记，整理的很好，里面有很多可以学习和参考的很多 ...

Spateo-空间转录组分析流程2：空间可变基因

文摘 2024-12-04 07:01 北京

这是一个系列教程：前几天介绍了第一篇，这次接着分析：Spateo-空间转录组的瑞士军刀-教程1：细胞分割单细胞分析的一个重要步骤就是高可变基因（highly variabl ...

T细胞注释搞不清楚，最近刚发的这篇Nat Methods肯定能给你整明白

文摘 2024-12-03 07:01 北京

不设置🌟有时会收不到公众号内容，code一段时间后会失效,代码地址在文末T细胞分群太多了，确实用些工具进行辅助注释会比较轻松些scAtlasVAE模型为CD8+ T细胞图谱 ...

Spateo-空间转录组的瑞士军刀-教程1：细胞分割

文摘 2024-12-02 07:03 北京

前几天和大家介绍了发表在Cell正刊上的空间转录组分析方法：真漂亮，这是这个月华大空间技术的第二篇Cell了，看看他们的3D时空建模框架——Spateo。这个方法2022年 ...

没有服务器，单细胞数据搞不定？我们目前做好了这些pipeline，可以帮你做

文摘 2024-12-01 09:16 北京

后台老是有小伙伴诉说，没有服务器，没办法处理单细胞数据，其实他们也在学习单细胞数据分析，但是单细胞的上游分析太吃服务器了，特别是现在单细胞也便宜了，很多时候一做都是10几个 ...

生信钱同学

北京大学在读博士生，记录自己的学习日常🌞分享生信知识：如单细胞和空间测序、多组学分析、宏基因组、病理组学、影像组学等生物信息学、机器学习和深度学习内容🌬

分类

时事

民生

政务

教育

文化

科技

财富

体娱

健康

情感

旅行

百科

职场

楼市

企业

乐活

学术

汽车

时尚

创业

美食

幽默

美体

文摘

原创标签

时事社会财经军事教育体育科技汽车科学房产搞笑综艺明星音乐动漫游戏时尚健康旅游美食生活摄影宠物职场育儿情感小说曲艺文化历史三农文学娱乐电影视频图片新闻宗教电视剧纪录片广告创意壁纸头像心灵鸡汤星座命理教育培训艺术文化金融财经健康医疗美妆时尚餐饮美食母婴育儿社会新闻工业农业时事政治星座占卜幽默笑话独立短篇连载作品文化历史科技互联网

发布位置

广东北京山东江苏河南浙江山西福建河北上海四川陕西湖南安徽湖北内蒙古江西云南广西甘肃辽宁黑龙江贵州新疆重庆吉林天津海南青海宁夏西藏香港澳门台湾美国加拿大澳大利亚日本新加坡英国西班牙新西兰韩国泰国法国德国意大利缅甸菲律宾马来西亚越南荷兰柬埔寨俄罗斯巴西智利卢森堡芬兰瑞典比利时瑞士土耳其斐济挪威朝鲜尼日利亚阿根廷匈牙利爱尔兰印度老挝葡萄牙乌克兰印度尼西亚哈萨克斯坦塔吉克斯坦希腊南非蒙古奥地利肯尼亚加纳丹麦津巴布韦埃及坦桑尼亚捷克阿联酋安哥拉