如今,要想拿顶刊,关键在于数据量大、结果出色和有效运用人工智能。而科研上的竞争已经不紧紧是卷时间,卷仪器,还在卷效率,卷算法。有的课题组阳性细胞还在拿手数,而有的课题组,多组实验多通道层扫图像时间序列(4D)都分析出来了。
1. Trainable Weka Segmentation (TWS):万能分割框架,高效处理复杂图像
TWS用于对图像进行区域分割,比如细胞,颗粒,气泡,纤维,都值得用它试一试。使用极其简单,直接画几笔,图像分割就解决了,再也不用繁琐地一步步预处理后处理调参数,真香!
这插件背后是随机森林(机器学习的一种)驱动,专治阈值法处理不了的困难图像,很多更专业的 plugin 也是基于这个,比如分析肌肉细胞 Myosoft。
2. Cellpose:细胞分割领域的明星工具,轻松实现批量分割,省时省力
细胞分割在 2020 年以后迎来了 GPT 时刻,就是因为 Cellpose 的发表。这是一个专注于各种细胞分割的神级模型,多次登上顶刊(e.g. Nature Methods)。
它就像是细胞分割界的苹果,使用体验非常丝滑,这个领域后来的模型都拿 Cellpose 分割能力做对比,虽然四年来有其它模型在特定领域能赢过它,但在易用性和文档的完整性上,Cellpose 无疑还是老大哥,完全不需要编程经验,即装即用。结果还能存成 ImageJ 中的 ROI,实在太贴心!
3. TrackMate:追踪利器,集分割与可视化于一体
如果你有一组时间序列图像需要追踪特定物体,那么你可能听说过 ImageJ 中的 TrackMate 插件。这款插件集成了图像分割、物体追踪和数据可视化三大核心功能,全面满足你的分析需求。
更可喜的是,它的图像分割是与时俱进的,它与机器学习的结合,比如 trackmate-weka,trackmate-starDist,trackmate-cellpose 这些强强联合的衍生插件,让物体追踪的精度和适应性达到了前所未有的高度。
4. Segment Anything(SAM):万能分割模型,高效处理复杂图像
META(前 Facebook)在图像分割上的大模型,仅仅1年时间,已经被超过 6000篇科研论文引用。可以说,在一个传统领域,用 SAM 实现一个新颖的自动化解决一个曾经繁琐的问题,就足以发一篇不错的论文。它的易用性和强大的分割直出能力颠覆了很多行业,而今年新出的 SAM2 更是把分割效率推向新的高潮,视频分割也不在话下。
在科研领域,SAM 也形成了自己的生态,基于 SAM 的微调模型也很有影响力,比如医学领域的 MedSAM,成为了医生图像分析神器,Github 半年狂揽 3k stars。
看到这里说明你是一个非常好学的人!如果我告诉你可以 三天 快速掌握以上所有内容,让科研能力跃升一个新高度,你心动吗?
很荣幸在这里引起了你的关注,我是 Bilibili图像处理区知名up主,思语视觉 的创始人阿图。2024 年即将结束,我为你准备了一个难得的机会:
为期三天的 AI 图像处理训练营,为 2024 画上完美的句号!
这是上百个硕博和青年导师找我咨询下来多年积累的经验,最高客单价 5 位数,有的已经发论文顶刊 。我把这些内容提炼出来精华中的精华,放到这个训练营,希望也能够帮到你。
非编程AI图像处理训练营
第一天:
数字图像处理的初衷
AI 图像处理的发展
随机森林和 TWS 原理
TWS 实操与预处理
多张图像的训练方法
自动化:预处理+TWS 分割+后处理
项目实战:自动化分析多张复杂图像
Bonus 1: TWS API 更快更好地自动化
Bonus 2: TWS-trackmate 应对目标追踪
第二天:
细胞分割的挑战
Cellpose 系列论文浅读与原理介绍
Cellpose 安装与实操
Cellpose 自动化分析多张图像
项目实战:Cellpose 批量分析运动细胞
Bonus : Cellpose + TWS 结合的自动化方案
第三天:
Segment Anything Model 与 SAMJ
MedSAM 在 3D 分割中的应用
SAM2 视频分析简介
总复习与展望
交流答疑
课程能够带给你的能力
拿到成堆需要处理的图片后,你将学会:
快速找到最实用的工具:简单易学,方便安装,轻松上手。
掌握清晰的处理步骤:遇到难题时,知道如何逐步尝试不同的方法,直至成功。
轻松掌握自动化技巧:熟练操作每个自动化处理工具,让批量分析变得快捷高效。
课程适合的人群:
科研行业的职场一族,想要 更新技能,领军项目,升职加薪! 熬夜处理图像的高校学生,正在 毕业赶 due,想要 提高效率,发表论文! 对图像处理饶有兴趣的朋友,闲暇时间想 学点技巧,赚点外快!
过往咨询客户对阿图好评如潮(部分截图):
以下是课程信息:
讲师介绍
Bilibili 图像处理区知名 up 主
开营时间
12月6日- 8日;12月13日-15日;12月20日-22日
适用范围
课程价格
本文为广告,服务由《思语视觉》提供。