科 / 研 / 图 / 像 / 处 / 理
ROI (Region of Interest)，即感兴趣区域。
ImageJ 中，ROI 不仅包括各种规则、不规则的选取区（Selection），还包括点、文字、图片等。
在 ImageJ 中，可以通过对 ROI 进行各种灵活地操作，从而选中图像的局部进行操作或测量：
https://imagej.net/ij/docs/guide/146-10.html
ImageJ 中，图像上默认只能 active 显示一个 ROI。
如果要在图片中定义并显示多个 ROI，需要 利用 ROI Manager 对多个 ROI 进行管理 (Analyze -> Tools -> ROI Manager)：
这篇文章会介绍 ImageJ 中对 ROI/Selection 的一些基本操作，从而可以灵活对 ROI 进行各种变换。
一、创建Selection
（1）工具栏创建
ImageJ 的工具栏有矩形、圆形、多边形、自由、直线选取工具：
在矩形工具处点击右键，可以选择3种不同的矩形：
在圆形工具处点击右键，可以选择圆形、椭圆以及 Selection Brush Tool：
Selection Brush Tool 是对 ROI 进行精修的工具，从 ROI 内向外可以扩展，从外向 ROI 内擦除。
双击图标改变画笔尺寸，从而可以对 ROI 进行精修，构造出任意形状的 ROI。
（2）Edit -> Selection -> Specify创建
除了手动框选，还可以在图像上的特定位置，构造特定尺寸的矩形或圆形：
二、Selection 操作
（1）基于 Edit -> Selection
在 Edit -> Selection 中有许多对于 Selection 的操作，包括对 Selection 进行扩大/缩小，平移旋转：
以 Enlarge 为例，Enlarge 可以沿着 Selection 的边缘扩大或者缩小特定 pixel。
从而可以将一个大的 Selection 按照轮廓，以一定步长进行等分：
另外还可以对 Selection 进行 插值 (Interpolate) 以及计算 凸包 (Convex Hull)：
关于 Convex Hull 的应用可以参考：
（2）基于 ROI Manager
ROI Manager 中也可以对单个 Selection 进行操作，点击 ROI Manager 中的 More：
而且 ROI Manager 还可以对多个 ROI 进行布尔运算以及线性插值等操作。
例如对多个 ROI 进行布尔运算，在 ROI Manager 中按住 Shift 键选择两个 ROI，在 More 中选择 AND，可以取两个 ROI 重叠的部分：
ROI Manager 也可以实现 ROI 之间的线性插值。
例如在选取 3D 的 ROI 时，如果一层一层进行选取，非常耗时耗力。
但如果在一定范围内 ROI 随着 Z 是线性变化的，就可以在 起始层和结束层 分别框选一个 ROI。
然后在 ROI Manager 中按住 Shift 键选择两个 ROI，在 More 中选择 Interpolate ROIs，在之间的层进行插值。
往期回顾
