fill属性改变形状内部的颜色，比如条形图的填充色或者圆的内部颜色。 color属性修改形状的边框颜色。
示例代码：![]()
library(ggplot2)ggplot(mtcars,aes(x=drat))+geom_density(color="purple",fill="#69b3a2",size=2)
2. 选择颜色的五种方法
- 颜色名称
：使用内置的颜色名称，如"red"、"blue"等。 - 十六进制代码
：直接输入颜色代码，如"#FF5733"。 - RGB/RGBA
：使用红、绿、蓝值来指定颜色。 - HSL/HSLA
：使用色调、饱和度和亮度来定义颜色。 - 颜色调色板
：使用预定义的颜色调色板，以确保多个图形之间的一致性。
2.1 自动分配颜色给变量
示例代码：![]()
library(ggplot2)ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width,color=Species))+geom_point(size=6)
3. 改变颜色比例尺
- ggplot2内置
：使用 scale_color_manual()进行自定义颜色映射。 - R Color Brewer
：使用 scale_color_brewer()获得美观的颜色调色板。 - Viridis
：适合色盲友好和出版质量的图形。 - Paletteer
：提供超过2500+种现成的颜色调色板。
示例代码：![]()
p<-ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width,color=Species))+ geom_point(size=6) + scale_color_brewer(palette="PuOr")
p<-ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width,color=Species))+geom_point(size=6) +scale_color_brewer(palette="PuOr")
4. Paletteer：R颜色调色板的终极目录
scale_fill_gradientn(colors = colorRampPalette(c("blue","white","green"))(12))#colorRampPalette(c("royalblue","firebrick3"))(2)
monocle2 更改点的颜色 monocle2 更改点的颜色mypal <- ggsci::pal_aaas(palette = c("default"), alpha = 0.7)(10) ;mypalscales::show_col(mypal,ncol = 5)选择想要的颜色搭配RColorBrewer::display.brewer.all()RColorBrewer::brewer.pal(8, 'BrBG')cols_1<-RColorBrewer::brewer.pal(8, 'Dark2') ;cols_1plot_cell_trajectory(cds, color_by = 'celltype')+ facet_wrap(~ celltype)pdf("2.split.pseudutime.stim.pdf")plot_cell_trajectory(cds, color_by = "celltype") + facet_wrap(~ celltype) +scale_colour_manual(values =c("#EE0000B2", "#008B45B2", "#008280B2","purple") #cols_1# aesthetics = c("colour", "fill"))dev.off()
分类变量和连续变量的颜色设置
ggplot(vis.data, aes(x=col, y=row, color = Bnip3l)) + geom_point() + theme_void()+# scale_discrete_manual()scale_fill_gradient(low = "blue",high = "red",space = "Lab",na.value = "grey50",guide = "colourbar",aesthetics = "color" #fill)ggplot(vis.data, aes(x=col, y=row, color = Bnip3l)) + geom_point() + theme_void()+# scale_discrete_manual()# scale_color_manual( colorRampPalette(c("blue","white","green"))(12) #针对分类变量scale_color_continuous(low = "blue",high = "green")
总结
https://github.com/EmilHvitfeldt/r-color-paletteshttps://r-graph-gallery.com/ggplot2-color.html
