【11月21日】共论“AI药物设计”｜复旦大学王任小分享：预测药物-靶标相互作用的深度学习模型，对话华山医院谢芳、英矽智能任峰
文摘
科学
2024-11-18 18:02
上海
药物分子与其靶标之间形成足够强的相互作用，是药物发挥疗效的必要条件。因此，定量预测药物-靶标相互作用是提高药物设计成功率的关键之一。
基于前期工作的基础，王任小研究员近年来发展了基于图神经网络的深度学习模型PLANET，该模型不依赖蛋白-配体复合物三维结构即可预测靶标亲合性，可用于虚拟筛选，比传统分子对接方法速度提高了三个数量级，可在常规硬件平台上实现对10亿级化合物库的虚拟筛选。并进一步发展了预测生物活性分子靶标的方法COMET，该方法综合了基于配体算法和基于结构算法的优势，预测靶标的成功率显著超越目前常用的反向钓靶算法。以上这些新方法和新工具在人工智能驱动的药物发现中，均具有重要的应用价值。
11月21日 周四晚8点，非常荣幸邀请到了 复旦大学药学院药物化学系主任 王任小研究员，做客【光华会客厅】第77期，为大家分享“预测药物-靶标相互作用的深度学习模型”的精彩故事。
同时，也非常荣幸邀请到了复旦大学附属华山医院 谢芳研究员、英矽智能联席CEO 任峰博士，与本期讲者一同分别从“产、研、医”不同的背景和视角展开交流与探讨，促进行业的融合与创新，带来“产学研医用，跨界新思辨”！复旦大学药学院
药物化学系主任
特聘研究员、博士生导师
国家杰出青年科学基金获得者。兼任中国化学会计算机化学专委会副主任、中国化学会化学生物学专委会委员、中国生物信息学学会药物发现专委会委员、上海市药学会药物化学专委会委员。
擅长发展人工智能药物设计的新方法，以及针对新靶标开展药物发现。学术生涯已发表SCI论文150余篇(谷歌学术统计他人引用16000余次，H指数为50)，获得国家发明专利授权和软件著作权40余项。曾先后获得“药明康德生命化学研究奖”、中国化学会“青年计算化学家奖”、中国药学会-施维雅“青年药物化学家”等国内知名奖项以及国际化学信息学会“Corwin Hansch Award”。
复旦大学附属华山医院
核医学/PET中心副主任
研究员、博士生导师
科技部科技创新2030重大项目(青年项目)首席科学家，复旦大学卓学优秀人才。北京师范大学放射性药物教育部重点实验室与德国亥姆霍兹德累斯顿罗森多夫研究中心联合培养博士。美国德克萨斯大学西南医学中心博士后。任中华医学会核医学分会青年委员会委员/放射性药物学组委员、中国药学会放射性药物分会委员、中国核学会放射性药物学会理事等职务。担任Alzheimers Dement 、J Alzheimers Dis、View Medicine副主编、EJNMMI编委。
主要从事分子探针的开发及临床转化，神经分子影像及阿尔茨海默病影像队列建设，以及肿瘤影像。以通讯作者在Nat Commun、Radiology、Eur Urol、Clin Cancer Res、Mol Psychiatry等杂志发表SCI论文100余篇。主持科技部科技创新2030-“脑科学与类脑研究”重大项目(青年项目)，国家自然科学基金2项，上海市基金多项，并参与国自然重点，科技部重大等多项重大项目。以第一发明人参与发明专利多项，担任40多本杂志审稿人。
2007年博士毕业于美国哈佛大学化学系。拥有十余年跨国药企创新药研发经历。发表国际学术论文60余篇、国际专利90余件。曾任葛兰素史克神经退行性疾病研发部药化总监，化学部负责人。2018年加入美迪西任高级副总裁，负责公司化学部和生物部的研发服务(2019年于“科创板”上市)。
2021年加入英矽智能，负责使用公司的人工智能(AI)平台构建药物研发管线及外部项目合作，并优化公司的AI平台。带领团队成功开发出治疗特发性肺纤维化的全球首个AI发现的新靶点新分子药物进入临床二期，并开发出其它7款临床一期的药物治疗溃疡性结肠炎、癌症及新冠等疾病。
主导了英矽智能与复星医药的首付款1350万美元的AI制药战略合作，以及英矽智能与赛诺菲的首付款2150万美元总金额12亿美元的AI制药战略合作，创下了亚太地区AI制药交易金额最大的合作。完成了一个临床一期项目的对外授权转让(美国上市公司Exelixis)，预付款高达8000万美元，以及一个总金额逾5亿美元的临床前项目的对外授权转让(欧洲公司Menarini)。
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