GastroPlus的Population Simulator各选项的作用及如何使用?

科技   2025-01-03 12:22   上海  

GastroPlus模型常见参数含义与设置汇总

 

GastroPlus的Population Simulator各选项的作用及如何使用?

问题描述

在GastroPlus的Simulation界面下,有Single Sim, Batch Sim等5个Simulation Mode。其中Population Simulator各选项的作用是什么,以及如何进行操作?

回答

  • Population Simulator是对某个选中的record进行群体模拟,以考察模型参数、生理参数等数据变异时,药物体内暴露曲线的变化情况,其操作界面如下:

  • 在Population Simulator界面中Parameters选项下有Clear All, Add All, Add Select, Set Default四个子选项。这四个选择分别用于清除当前人群模拟选择的所有参数(Clear All)、将参数重置为默认选择的参数(Add All)、手动进行参数选择(Add Select)、将所选参数(当前显示在Population Simulator界面的参数)设置的修改值(修改的Mean Value, CV%和Distribution)重置为默认值。

    注意:“Set Default”按钮不是用于重新选择参数,只是用于重置参数设置,即重置Mean Value, CV%或Distribution的设置。



  • 在Population Simulator界面中Population选项下有Set PEAR, Load Previous, Create New三个子选项。其中,Set PEAR仅适用于人体PBPK模型的群体模拟,点击该按钮将会打开Population Simulator PEAR Settings窗口(如下图),该窗口用于设置群体模拟时人口参数的产生范围。



  • Load Previous用于调用先前已产生的人群信息,可以保持相同的人口学信息进行群体模拟,也能用于建立交叉BE的模拟场景,以便直接地比较不同制剂(或处方)的BE情况。当单击此按钮后,将出现一个窗口,用户可以从中选择一个或多个已输出文件,这些文件来自之前运行的同一类型的一次或多次人群模拟的结果,GastroPlus将加载在该群体模拟时生成的群体,并结合新制剂(或处方)的特性(剂量、粒径、粒径形状因子、粒径的标准差、Weibull参数等)一起用于BE模拟。
  • Create New用于取消Load Previous的设置。
  • 在Population Simulator界面中的Select Outputs用于选择群体模拟的输出结果。
  • 在Population Simulator界面中的Dose is defined in用于选择群体模拟的给药剂量。仅在人体PBPK模型中可以设置mg/m^2为单位的给药剂量,当选择以mg/kg或mg/m^2为单位的给药剂量时,也只支持设置mL/kg或mL/m^2的剂量体积和最大剂量体积。
  • Output Points用于设置输出的血药浓度-时间曲线数据点的数量。

  • Repeated Trials用于设置重复群体模拟的次数,比如通过统计重复模拟10次的BE情况,计算BE的成功率。

  • Sample Size (Maximum = 2500)用于设置群体模拟的受试者例数,最大2500例受试者。
  • Use this run as reference in BE calculations用于指定群体模拟时的参比制剂。
  • Intrasubject Settings用于设置受试者个体内变异,当选择Load Previous后,Intrasubject Settings设置将被激活。其中,No Intrasubject Variability:不使用个体内变异;Simulate Physiologic Intrasubject Variability:使用模拟的受试者个体内变异,个体内变异的生理参数包括胃肠道转运时间、体积、pH值和胆盐浓度;Apply Intrasubject CV% to Cmax and AUC:使用蒙特卡洛抽样进行常规人群模拟后将受试个体内变异性应用于Cmax和AUC,该选项支持用户根据观测值自定义Cmax和AUC的CV%,软件将根据设置Sampling Distribution和CV%对Cmax和AUC进行重新采样。


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