杂志卷期
Human Reproduction, 2024, 00(0), 1-12
题目
多组学PGT:基于RNA测序重新评估整倍体囊胚的植入潜力。
作者
Jiamin Jin et al. 浙江大学医学院附属邵逸夫医院生殖中心等
研究问题
除了染色体的整倍性外,囊胚的转录组是否可以作为一个新的预测胚胎植入潜力的指标?
研究设计
该研究纳入了2022年3月至2023年7月期间行PGT-A的102名患者的412枚囊胚。活检样本被分成两部分,分别进行DNA和RNA测序(DNA-seq和RNA-seq)。一部分用于PGT-A检测DNA拷贝数变异,而另一部分则同时通过RNA-seq评估转录组特征。为了验证从这种策略获得的RNA-seq的可靠性和准确性,该团队首先分析了染色体非整倍体囊胚的转录组。随后,该团队比较了形成速度不同(D5与D6)的囊胚的转录组特征。为了评估整倍体囊胚的植入潜力,该团队确定了临床妊娠和未妊娠的整倍体囊胚之间的差异表达基因(DEGs),并利用这些DEGs构建了一个优化的囊胚选择预测模型。
结果数据
RNA数据可以推断出三体和单体染色体异常。在第5天和第6天形成的正常囊胚中,发现187个差异表达基因,这些基因主要参与了胚胎胎盘发育的细胞分化、PPAR信号通路和Notch信号通路。此外,利用临床妊娠或未临床妊娠的囊胚之间的280个差异表达基因进行建模,优化了正常囊胚的选择。最后,利用RF(随机森林)模型对83个移植的正常囊胚进行回顾性分析,确定了三种具有着床潜力递减趋势的正常囊胚类型,良好组的着床率显著高于中等组(88.6% vs 50.0%,P=0.001),而中等组的着床率又高于差劲组(50.0% vs 20.8%,P=0.035)。
临床意义
囊胚的转录组分析为预测胚胎着床潜力提供了一种新的方法,可以用来优化临床胚胎选择。
个人简介
乔森,助理研究员,研究方向为生殖遗传。累计发表SCI论文19篇,中文核心1篇,以通讯/第一作者发表SCI论文10篇,包括Nature Communications, Cell Reports, Cell Death Discovery,Endocrinology等国际权威期刊。累积影响因子136。
采写:乔森
审核:施文浩
编辑:刘小华
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