大家好，欢迎观看《时空日报》第345期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
sc2GWAS：连接人类单细胞和GWAS特征的综合平台
sc2GWAS: a comprehensive platform linking single cell and GWAS traits of human
Nucleic Acids Res; IF: 16.600; DOI: 10.1093/nar/gkae1008
内容概要：
① 识别与风险变异相关的细胞群体，在揭示驱动疾病发展和进展的细胞特异性机制方面至关重要。为了更深入地理解这些机制，科学家们采用了一种有效的策略，即将基因组关联研究（GWAS）与单细胞RNA测序（scRNA-seq）相结合。这一策略使得研究人员能够检测性状与细胞之间的复杂关系。然而，随着性状相关单细胞数据的不断积累，如何对这些数据进行全面处理成为了一个亟待解决的问题。
② 为了应对这一挑战，研究团队开发了一个名为sc2GWAS的平台。该平台旨在以单细胞分辨率记录大规模的GWAS性状-细胞调控对，并为这些相关的对提供全面的注释和富集分析。sc2GWAS从超过630万个单个细胞中整理了总共15,078,310个候选性状-细胞对，为研究人员提供了宝贵的资源，使他们能够更深入地探索性状与细胞之间复杂的调控关系。此外，研究团队还对scRNA-seq数据和GWAS数据实施了严格的质量控制措施，以确保用于识别性状相关细胞和基因的数据集的可靠性和准确性。
③ sc2GWAS平台不仅提供了丰富的候选性状-细胞对，还为研究人员提供了性状相关基因的排名列表和广泛的（表观）遗传注释。这些功能使得sc2GWAS成为下游分析的有用资源。为了证明该平台的实用性，研究团队以阿尔茨海默病为例进行了研究，并发现该病与小胶质细胞之间存在显著关联，其中APOE基因尤为显著。这一发现进一步证明了sc2GWAS平台在探索GWAS性状-细胞调控机制方面的潜力和价值。未来，随着研究的深入，sc2GWAS有望成为一个更加全面和宝贵的平台，为科研人员提供更多有用的信息和工具。
图形摘要
生信工具：疾病发展机制, GWAS, scRNA-seq, sc2GWAS平台, 单细胞分辨率, 性状-细胞调控对, 质量控制, 性状相关基因, 遗传注释, 阿尔茨海默病, 小胶质细胞, APOE基因，scRNA-seq; Yin M, Feng C, Yu Z, et al.; The First Affiliated Hospital & National Health Commission Key Laboratory of Birth Defect Research and Prevention, Hengyang Medical School, University of South China, Hengyang, Hunan 421001, China.
阻断Roundabout 1和2信号传导的单克隆抗体通过髓系细胞靶向病理性眼部新生血管
Monoclonal antibodies that block Roundabout 1 and 2 signaling target pathological ocular neovascularization through myeloid cells
Sci Transl Med; IF: 15.800; DOI: 10.1126/scitranslmed.adn8388
内容概要：
① 科研人员深入研究了Roundabout（ROBO）1和2这两种跨膜受体。这两种受体通过其细胞外结构域（ECDs）与分泌的SLIT配体结合，并通过其细胞质结构域传递信号，从而调节细胞骨架并控制细胞的迁移、粘附和增殖。这一发现揭示了ROBO1和ROBO2在细胞调控中的重要作用。
② 然而，研究人员发现SLIT-ROBO信号传导的异常与病理性眼部新生血管化密切相关，这是全球视力丧失的主要原因之一。为了应对这一挑战，研究人员开发出了针对ROBO1和ROBO2细胞外结构域的人源单克隆抗体（mAbs）。其中一种抗体能够有效地抑制体外SLIT2通过ROBO1和ROBO2的信号传导，并在小鼠模型中显著减少了眼部新生血管化。
③ 进一步的研究表明，这种抗体治疗不仅影响了与血管生成相关的多种细胞类型，包括内皮细胞、周细胞和髓系细胞，还改善了视网膜屏障的完整性，并阻止了病理性周细胞的激活。此外，研究人员还发现，通过抑制SLIT-ROBO信号传导，可以防止髓系细胞的病理性激活，并增加神经保护性髓系细胞群。这些发现为治疗眼部新生血管疾病提供了新的策略，并有望为致盲眼病的抗炎治疗带来希望。
Pik3cg基因敲除可阻止视网膜新生血管化
疾病研究：跨膜受体, SLIT配体, 细胞外结构域（ECDs）, 细胞质结构域, 细胞调控, 病理性眼部新生血管化, 人源单克隆抗体（mAbs）, 抗体治疗, 内皮细胞, 周细胞, 髓系细胞, 血视网膜屏障, 神经保护性髓系细胞群, 眼部新生血管疾病, 抗炎治疗，scRNA-seq; Geraldo LH, Xu Y, Mouthon G, et al.; Cardiovascular Research Center, Department of Internal Medicine, Yale University School of Medicine, New Haven, CT 06510, USA.
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审校 | 赵芳
题图 | 彭卫
排版 | 小飞鱼
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