大家好，欢迎观看《时空日报》第340期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
scProAtlas：人类组织中的多重单细胞空间蛋白质组学成像图谱
scProAtlas: an atlas of multiplexed single-cell spatial proteomics imaging in human tissues
Nucleic Acids Research; IF: 16.600; DOI: 10.1093/nar/gkae990
内容概要：
① 空间蛋白质组学是一项先进的技术，它能够在单细胞分辨率下可视化和量化组织内部的蛋白质表达谱。尽管与空间转录组学相比，这项技术所能检测的蛋白质数量有限，但它仍然能够提供详尽的空间信息，这些信息对于理解细胞在组织中的分布和功能至关重要。
② 为了更深入地探索组织内部的空间背景，科研人员构建了一个名为scProAtlas的综合性空间蛋白质组学功能注释知识库。这个知识库旨在帮助用户全面理解不同组织类型在不同尺度、以单细胞分辨率呈现的空间背景。scProAtlas包含了多个功能模块，如邻域分析、邻近分析和邻域网络，这些模块能够综合构建组织的空间细胞图谱，并进行多模态整合。此外，该知识库还具备空间基因识别、细胞间相互作用和空间通路分析等功能，以展示空间可变基因。
③ scProAtlas知识库涵盖了来自15种不同组织的8种空间蛋白质成像技术数据，为来自945个感兴趣区域的17,468,394个细胞提供了详细的功能注释信息。这个知识库的建立，旨在为用户提供一种全新的视角来观察和理解各种组织的空间结构，并提供详细的空间功能注释。通过scProAtlas，科研人员可以更加深入地探索细胞在组织中的分布和功能，为疾病诊断和治疗提供新的思路和方法。
图形摘要
分析工具：空间蛋白质组学, scProAtlas, 知识库, 组织, 单细胞分辨率, 功能注释; Tiangang Wang, Xuanmin Chen, Yujuan Han, Jiahao Yi, et al.; Center for Computational Systems Medicine, School of Biomedical Informatics, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, USA.
补体与小胶质细胞激活介导雄性小鼠内侧前额叶皮层第2/3层应激诱导的突触丢失
Complement and microglia activation mediate stress-induced synapse loss in layer 2/3 of the medial prefrontal cortex in male mice
Nature Communications; IF: 14.700; DOI: 10.1038/s41467-024-54007-5
内容概要：
① 空间异质性突触丢失是众多精神和神经疾病的典型特征，但其背后的机制至今尚未明确。本研究在雄性小鼠体内发现了新的线索，一种空间局限性的补体激活机制能够介导应激诱导的小胶质细胞异质性激活，并导致内侧前额叶皮层（mPFC）上层的突触丢失。
② 通过单细胞RNA测序技术，研究者们进一步发现了一种与应激相关的小胶质细胞状态，这种状态的显著特征是载脂蛋白E基因（Apoe）在mPFC上层的高表达。值得注意的是，缺乏补体成分C3的小鼠在应激诱导下能够免受层特异性突触丢失，且这些小鼠mPFC中的Apoe高表达小胶质细胞数量显著减少。
③ 进一步的研究揭示，C3敲除小鼠不仅对应激诱导的突触丢失具有抵抗力，还对应激诱导的快感缺失和工作记忆行为缺陷表现出较强的抵抗力。这些发现表明，特定脑区的补体激活和小胶质细胞激活可能是多种脑疾病中观察到的疾病特异性、空间局限性的突触丢失模式及临床症状的重要诱因。
多种应激方案会在内侧前额叶皮层（mPFC）引发层特异性的补体激活
疾病研究：空间异质性突触丢失，精神和神经疾病，补体激活，小胶质细胞激活，雄性小鼠，载脂蛋白E基因，scRNA-seq ; Tillmon H, Soteros BM, Shen L, et al. ; Department of Pharmacology, University of Texas Health at San Antonio, San Antonio, TX, 78229, USA.
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审校 | 赵芳
题图 | 彭卫
排版 | 小飞鱼
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